01读文献并下载数据

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本文分析的数据来自于文章：Reliability of Whole-Exome Sequencing for Assessing Intratumor Genetic Heterogeneity, Shi et al., 2018, Cell Reports

https://doi.org/10.1016/j.celrep.2018.10.046

原文作者主要是为了对比不同数据处理流程的结果异同与是否可靠，数据处理流程如下：

主要的全外显子组测序有：6 个 case，每个 case 有 5 个样本，分别是一个 Germline，A、B、C 三个 Biological replicate，一个 Technical replicate，一共是 30 个样本。

方法一：下载SRA数据

（不推荐）

NCBI 的 Sequence Read Archive (SRA)，每个项目的

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