热图pheatmap 热图3：热图行列分组信息注释

热图pheatmap

library(pheatmap)

getwd()

setwd(“D:\Win10 System\Documents\WeChat Files\wxid_f27yna03e0v622\FileStorage\File\2022-05\miRNAdiffer\miRNAdiffer”)
mymatrix=read.table(“D:\Win10 System\Documents\WeChat Files\wxid_f27yna03e0v622\FileStorage\File\2022-05\miRNAdiffer\miRNAdiffer\mirnaMatrix.txt”,
sep=“”,header=TRUE)
head(mymatrix)
row.names(mymatrix)=mymatrix$geneNames
mymatrix=mymatrix[,-1]
head(mymatrix)

data<-data.matrix(mymatrix)
head(data)
table(data>100)

samples=colnames(data)
annotation_col=data.frame(samples=colnames(data),groups=c(rep('Exp',4),'Con'))

library(pheatmap)
pdf(‘heatmap.pdf’,height=60,width=60) #``输出的图PDF存于所设定的文件夹
pheatmap(data, annotation_col=annotation_col,
show_colnames = TRUE,border_color = NA,show_rownames =F,
annotation_legend = F)
dev.off()

热图3：热图行列分组信息注释

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