qPCR引物设计经验教程
常规基因表达量qPCR检测,首要的是设计一对特异的检测引物,下边如期生物以人的“FAU1”基因为例给大家简要介绍一下如果使用NCBI这个网站设计qPCR
打开NCBI网站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/;界面如下
在NCBI搜索栏下拉框选择“Gene”;输入框输入对应的物种及基因信息,并点击“Search”键进行搜索如下所示
点击“search”后,跳转到如下界面;单击对应的基因项
点击基因名称后,跳转到如下界面;拉到底部转录本位置
如下图,选择需要检测的转录本;并单击
如下图,单击“pick primers”
修改设计参数:“PCR product size”设在70~150bp即可,太长会影响扩增效率;“Exon junction span”可选选择跨外显子排除基因组污染的干扰,不过目前市面上很多反转录试剂都带有去基因组的步骤,所以该选项不进行设置也可以 ;“Database”选项,选择Refseq RNA即可;最终参数设定如下,其他参数保留默认设置即可:
点击“get primers”选项,等待数据库匹配完后会出现如下界面:
然后选择GC百分比在45%-55%之间,Tm在60℃左右的引物,复制序列合成进行验证特异后即可用于qPCR检测。
qPCR引物设计经验教程相关推荐
- qPCR引物设计cdna cds exon 验证pcr引物实际的好坏 引物特异性检验 引物验证引物
一文搞懂!手把手教你精通各类引物设计 - 知乎说起引物,做科研同学并不陌生,应用也很广泛,比如:PCR.实时定量PCR.扩增基因片段等.今天给大家介绍不同引物设计的方法,并附赠超全引物设计工具包(点击 ...
- 使用linux批量引物设计,干货分享:如何快速设计多条qPCR引物?
原标题:干货分享:如何快速设计多条qPCR引物? 干货分享: 小伙伴们,新的一周已经开始啦,有没有从周末中复苏过来,今天首先让我们来了解一款快速设计多条qPCR引物的数据库. MRPrimer使用篇 ...
- ncbi查找目的基因序列_使用NCBI设计qPCR引物方法
对于分子生物学的研究者来讲,NCBI是科研过程中的一大神器,我们不仅可以在其中查找基因组.基因.蛋白,还可以在其中进行文献查找.序列比对等操作,连设计引物的功能NCBI也给我们构建好了,名字叫做Pri ...
- 荐读:FPGA设计经验之图像处理
荐读:FPGA设计经验之图像处理 今天和大侠简单聊一聊基于FPGA的图像处理,之前也和各位大侠聊过相关的图像处理,这里面也超链接了几篇,具体如下: 图像边缘检测算法体验步骤(Photoshop,Mat ...
- 双轮载人平衡车设计完整教程之调校测试篇
双轮载人平衡车设计完整教程之调校测试篇 实验及路测结果 6.1 硬件测试 6.1.1车体与元件安装 车体采用的是精钢打造的船型包厢,车体机械部分的安装及重量分布,直接影响到小车的平衡性能.拿起螺丝准备 ...
- 新冠病毒变异株核酸检测引物设计——代码实现1
上一期我们对新冠变异株核酸检测的方法原理进行了简介,本期我们主要讲一下,如何利用python语言实现我们特异性检测的目标. 一.文件读取 接着上一期我们下载新冠Alpha.Beta.Delta.Gam ...
- android ui框架详解,多图详解 “Android UI”设计官方教程(二)
编者注:本文为Android的官方开发者博客发了一份幻灯片的翻译文档的第二部分,专门介绍了一些Android UI设计的小贴士,我们在介绍这个幻灯片的第一部分<多图详解 "Androi ...
- Catia V5汽车设计实战教程
Catia V5汽车设计实战教程 与在汽车和工业工程领域拥有超过 18 年经验的设计工程师一起练习 Catia V5 课程英文名:Catia V5 Practice Projects - From B ...
- 精选31个网站界面设计实践教程
设计一个网站从来都不是一件容易的事.如果你去询问一位在该行业有丰富经验的网页设计师,他会告诉你以前根本没有太多关于Web设计/开发的资源.文章和各种沟通交流平台,更不用说高质量免费教程了. 如果您 ...
- 没工作经验新入职包装经验_我是如何从0设计经验转变为在12个月内从事全职工作的(重新发布)...
没工作经验新入职包装经验 by Richard Yang 理查德·杨(Richard Yang) 我是如何从0设计经验转变为在12个月内从事全职工作的 (How I went from 0 desig ...
最新文章
- Linux下用汇编输出Hello, world
- except but
- JAVA静态方法是否可以被继承
- 输出java_java基础----Java的格式化输出
- spss数据预处理步骤_数据处理之剔除无效问卷
- C#/WPF程序开机自动启动
- (转)令人无法理解的死锁案例分析
- thinkcmf 横向排列数据_Excel横向筛选出销量靠后的月份数据,你知道如何实现吗...
- Oracle管理文件OMF (oracle managed files)
- python pip安装+easy_install
- 学了python能干啥举例-第9p,Python是什么?学了Python能干什么?
- clover删除多余引导_[转载]EFI引导如何去掉多余的这个clover启动项
- matlab中断路器怎么表示什么,断路器符号及含义是什么(图文)
- 编程:获取股票实时行情数据大全
- 洛谷P1308统计单词数C语言
- 大屏幕显示屏 html,在大屏幕上显示墙的三种解决方案
- 风控数据来源及分析技巧
- 《鸟哥的Linux私房菜》Chapter6 20180806~20180810
- vue中 根据权限 动态的设置路由
- 两个程序员(Chris和Steve)的故事