寻找原噬菌体

1.1 PHAST

打开PHAST (地址见文末),输入基因组Genbank accession number/fasta件,点击submit.

1.2 选择prophage

选取PHAGE_Shigel_SfII

NCBI BLAST比对

2.1目标序列的比对

通过PHAST比对的结果,如下图标记的前者是基因组里的基因名,后者是噬菌体的GI号,下载蛋白序列进行NCBI blastp比对。

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