使用SnapGene绘制比较基因簇结构图
寻找原噬菌体
1.1 PHAST
打开PHAST (地址见文末),输入基因组Genbank accession number/fasta件,点击submit.
1.2 选择prophage
选取PHAGE_Shigel_SfII
NCBI BLAST比对
2.1目标序列的比对
通过PHAST比对的结果,如下图标记的前者是基因组里的基因名,后者是噬菌体的GI号,下载蛋白序列进行NCBI blastp比对。
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