安装gcc, cmake和itk

1. 安装gcc

在官网gcc网站上下载然后解压。

接下来执行如下命令

tar xzf gcc-4.6.2.tar.gz
cd gcc-4.6.2
./contrib/download_prerequisites
cd ..
mkdir objdir
cd objdir
$PWD/../gcc-4.6.2/configure --prefix=$HOME/GCC-4.6.2 --enable-languages=c,c++
make
make install

然后设置环境变量

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/path/to/gcc/lib64
export LIBRARY_PATH=/path/to/gcc/lib64:$LIBRARY_PATH
export CPATH=/path/to/gcc/lib64/include:$CPATH

设置alias

alias gcc=/path/to/gcc/bin/gcc
alias cc=/path/to/gcc/bin/cpp
alias g++=/path/to/gcc/bin/g++
alias c++=/path/to/gcc/bin/c++
alias CC=/path/to/gcc/bin//gccalias CXX=/path/to/gcc/bin/g++

2. 安装cmake

安装cmake
在cmake下载后,执行如下命令

make build && cd build../bootstrap --prefix=/install/pathmake -j20
make install

3. 安装itk

下载itk

安装:

tar -zxf InsightToolkit-5.2.1.tar.gz
cd InsightToolkit-5.2.1mkdir build
cd buildcmake -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr ..
make
make install

注意安装时build和源文件必须分开，否则报错。目录如下:

4. 在python中调用

一个需要注意的点是编译所有的.o，.a, .so文件时都需要使用-fPIC这个flag,即position independent code，否则可能会报错OSError: ****.so: undefined symbol: _Z11***ii。

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