Linux命令行如何使用图形化软件
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做生物信息一般是使用远程工具,连接Linux的命令行界面,如果遇到图片、网页等文件,就下载下来查看,这样虽然不是很方便,但是也能够凑合工作,毕竟不是经常使用。不过有些软件只有图形化话界面,例如megan6,megax等,可以使用windows后者mac版,但是内存不够,使用Linux版,远程登录,没有图形化。其实,是有办法远程打开图形化工具的,这些工具统称为X Server。Xmanager自带这样的工具,但是并不是免费的,这里面我们推荐免费的Xming工具。
Xming
Xming是一个在 Microsoft Windows 操作系统上运行 X Window System 的自由软件。Xming 的主要功能是通过在Linux平台上通过交叉编译的方法,实现了跨越操作系统对X GUI的表现。也就是将命令行终端的图形化窗口通过调用Xming工具来显示。例如常用的putty或者xshell等,都可以调用Xming。
下载安装
软件的下载安装非常容易,只有windows版本。安装下一步下一步即可,尽量不要修改默认安装目录,否则其他程序可能找不到。安装完了,无需启动修改配置,按照默认设置即可。
https://sourceforge.net/projects/xming/
xshell设置
打开xshell,选择一个登录session进行设置,首先选择隧道,然后选中转发X11连接到,Xshell默认是使用Xmanager的配套工具,我们选中下面的X DISPLAY即可。X display Location 为 localhost:0,这里的 0 就是配置 Xming时指定的 Display Number。默认即可。
重新登录,在命令行终端敲firefox命令,就可以打开图形化的火狐浏览器了。这里注意,由于显示图形化窗口需要占用很多资源,因此,通常都比较慢,不是特别流畅。查看一张图片还可以。如果你使用的是国外的亚马逊云,那么你可以Google一下了。
同理,我们调用megax程序。
putty设置
putty也可以使用xming。设置也不难,选中SSH -> X11,勾选Enable X11 forwarding。需要在下面X display location中填入“localhost 0:0"。这样就完成了配置,可以使用putty打开图形化程序了。
注意事项
1、如果经过以上步奏,还是无法打开图形化窗口,那么可能还需要对SSH服务端进行设置。修改/etc/ssh/sshd_config文件。
X11Forwarding yes #注释掉#,然后将no改为yes
然后重启sshd
service sshd restart
2、有些服务器可能没安装xauth导致无法编辑.Xauthority文件,需要安装xorg
yum install xorg-x11-xauth
3、无法使用display命令显示图片。
需要安装ImageMagic
yum install -y ImageMagick*
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