数据库|scMethBank：单细胞全基因组 DNA 甲基化图谱数据库

甲基化是DNA的一种重要化学修饰，可调节基因的表达和关闭，与癌症、衰老、老年痴呆等许多疾病密切相关，是表观遗传学的重要研究内容之一。测序技术的发展，极大促进了单细胞DNA甲基化研究。然而大量数据的不断积累，对单细胞DNA甲基化数据的管理和利用提出了巨大的挑战。scMethBank作为第一个开放访问的综合数据库，全面整合了不同研究发表的数据，可用于单细胞 DNA 甲基化数据和元数据的收集、整合、分析和可视化。

该数据库可访问地址：

https://ngdc.cncb.ac.cn/methbank/scm/

scMethBank包括了来自人类和小鼠的8328个样本的全基因组单细胞DNA甲基化图谱和原始数据，涵盖15个项目，29种细胞类型和两种疾病。胚胎细胞(11.0%)、癌细胞(14.4%)、生殖细胞(10.7%)、神经细胞(54.5%)、干细胞(7.9%)、其他类型的细胞(2.3%)均被记录在数据库中。生物学背景包括早期胚胎发育、癌症进展、细胞分化和衰老。

scMethBank中所有的数据都可以自由访问，支持数据集、组织、细胞类型、治疗方法、疾病等多项检索功能，用户还可以通过浏览、可视化、工具和下载四个功能模块浏览整个数据库。此外，在文档页面中可以访问数据库的使用说明。scMethBank旨在通过提供浏览、搜索、可视化、下载功能和用户友好的在线工具，帮助对细胞异质性感兴趣的研究人员在单细胞水平上探索和利用全基因组甲基化数据。

Tips

凌恩-盈飞团队

致力于开拓前沿分子生物学技术和高性能计算在生命科学研究、分子育种及人类健康领域的应用，旨在为生命科学领域客户提供国际领先的数据管理和分析解决方案。公司拥有多项自主专利技术和软件著作权，成功开发VG多样性分析软件、VG转录组分析软件、VG生信分析云平台、R J肿瘤信息管理系统（临床应用）、Y-STR/Y-SNP法医学分析平台（法医应用）、FD个人基因组分析和报告系统、FD祖源分析和报告系统、FD家系分析和报告系统、动植物物种数据库（水稻、蕨类、瓠瓜、旱獭、桉树等）、TMBQ靶向代谢组批量定量分析平台、蛋白代谢数据分析平台等。客户群体包括高等院校、科研院所、三甲医院及疾控中心，药企及基因检测公司等。

参考文献

scMethBank: a database for single-cell whole genomeDNA methylation maps.Nucleic Acids Research,2021

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