“ghost atoms”默认设置导致MDPD无法计算,添加一句命令轻松解决
大家好,我是小马老师。
使用lammps运行多体耗散粒子动力学(MDPD)时提示了一个错误:
在解决这个问题之前,先说说lammps中的一个概念:ghost atoms。
在lammps进行并行计算时,体系的原子会被分配到不同的cpu核心进行计算。
当一个cpu的原子A的近邻原子B处于另外一个cpu核心时,B称为A的“ghost atoms”。
“ghost”粒子保存在一个单独的列表list中,默认情况下,这个列表只保存ghost原子坐标,并不保存速度等信息。
但mpdp在进行计算时,需要ghost粒子的平移速度、角速度和角动量等速度信息。
因此,需要改变lammps默认设置,在list列表中保存ghost粒子的速度信息。
使用的命令为:
comm_modify vel yes
在in文件势函数代码之前添加这句命令后,程序就可以正常运行了:
lammps in文件编写相对复杂,如果在lammps模拟过程中遇到问题,可以在文章后面留言,也可以加QQ群或者微信联系我,在模拟过程中如果感觉有困难,可以报名参加一对一的咨询和指导,由我来帮你快速解决问题。
正式推出一对一咨询辅导服务,根据课题方向不同详细讲解对应的in文件编写方法、模拟关键技术、数据后处理,经一对一咨询辅导后能够独立编写出in文件。
具体内容可查看公众号一对一培训说明:lammps 一对一培训
免费试听:Cu融化模拟代码编写及启动运算方法
公众号案例代码以及学习交流,请加QQ群:754749935
扫描关注微信公众号:lammps加油站。
“ghost atoms”默认设置导致MDPD无法计算,添加一句命令轻松解决相关推荐
- Oracle Linux网卡参数默认设置导致ORA-603
环境:OEL6.8,ORACLE 11.2.0.4 双节点RAC 节点2 alert日志报错信息如下: Fri Nov 24 09:11:42 2017 skgxpvfynet: mtype: 61 ...
- Virtualbox6.1 SATA控制器默认设置导致jbd2低效磁盘访问
在Ubuntu20.04桌面环境中,我安装了Virtualbox6.1虚拟机环境,并新增了Ubuntu18.04 Server的虚拟机玩玩 在Ubuntu18.04虚拟机中,安装软件资源时,总是耗费比 ...
- 横坐标设置_默认设置解决不了?!三种办法来解决,保住了Excel的“面子”
office 实战案例分享,做有意义的事情,每天进步一点点,今天比昨天好,这不就是希望么? 问题: 客户要做如下图, 这个并不难,问题是做完了发现好像有哪里不对?仔细对比一下两张图,发现是 误差线的上 ...
- 已重置应用默认设置老是弹出 html,Win10系统总是提醒已重置应用默认设置怎么办?...
Windows10系统总是提醒已重置应用默认设置怎么办?Windows10系统已经发布了好几年了,所以现在越来越多的人开始使用Windows10系统,在使用Windows10系统的时候,在使用第三方软 ...
- jvm默认的初始化参数_您是否应该信任JVM中的默认设置?
jvm默认的初始化参数 如今,JVM被认为是智能的. 预期配置不多-只需设置要在启动脚本中使用的最大堆,您就可以进行了. 所有其他默认设置都很好. 大概我们当中有些人误以为. 实际上,在运行时期间发生 ...
- 您是否应该信任JVM中的默认设置?
如今,JVM被认为是智能的. 预期不会进行太多配置–只需设置要在启动脚本中使用的最大堆,您就可以进行了. 所有其他默认设置都很好. 大概我们当中有些人误以为. 实际上,在运行时期间发生了很多事情,无法 ...
- Unity Model:模型的默认设置面板
a.Meshes:网格. ·Scale Factor:缩放系数.unity中物理系统默认游戏世界中第一个单位等于一米.采用不同的软件.不同的单位(建议在三维软件中采用米制单位)创建的模型可以通过该功能 ...
- vscode默认设置
默认设置(json),是defaultSettings.json文件 {// 启用后,差异编辑器将忽略前导空格或尾随空格中的更改."diffEditor.ignoreTrimWhitespa ...
- 默认设置中的陷阱:CASS软件三角网生成问题
三角网在CASS软件有几大比较重要的用途:1.绘制等高线:2.三维模型生成:3.土方计算:4.表面积计算等.本篇内容给大家讲解一下,三角网无法正常生成的解决方案. 我们知道,软件的最终发布还有重要的阶 ...
最新文章
- 一篇文章教你搞定传说中的“随机森林”
- Windows Server 2003 备份和恢复的最佳做法
- 应急模拟系统功能结构图
- Post/Redirect/Get模式防止表单重复提交
- mysql保存特殊表情_让 MySQL 支持 emoji 表情等特殊字符存储
- pytorch学习 训练一个分类器(五)
- 2021百万年薪AI职位趋势:数据科学、Python、自动驾驶、AIOps你关注了么?
- 2019.7.26数组
- potala(5)——Unit Test and Cache
- educoder MongoDB 复制集 分片
- 美男子第一次的JAVA博客
- c语言单片机当型编程,手把手教你学单片机的C语言程序设计(十四).pdf
- python实现邮件发送图表_python基于SMTP实现可视化邮件发送
- 艾宾浩斯记忆表格excel_艾宾浩斯打卡群第二期邀请函
- 【2018.12.28】百度网盘永久保存2T容量办法
- ext动态树 java_基于Ext异步加载tree的实例 - Seraph115 - JavaEye技术网站
- 移动硬盘安装centos8
- 计算机丢失msvc80.dll,msvcr80.dll
- 生物大分子的计算机模拟就业,生物大分子体系结合自由能及构象变化的计算机模拟...
- 天龙手游角色删除服务器还有显示,天龙八部手游怎么删除角色_角色删除方法详解_玩游戏网...