进阶必看 | R包制作指南-windows系统
R包制作指南
- 准备工作
- 开始创建R包
- 在Rstudio内完成R包构建
先前与大家分享过如何安装和使用R包,也与大家分享过自定义函数,这些都是R包的基础。一般来说,会将写好的函数进行封装,打包起来,制作成包,然后上传到各大平台便于推广和使用。今天我也大家分享一下自己制作R包的全过程,包教包会!~
准备工作
- 首先将所需打包的函数 (能够完成某一目的/功能的R函数) 保存为".R" ( 以R结尾 ) 文件;如图所示:
- 打开对应函数,每个".R"文件中必须添加"标题"、“描述”、“参数”、“作者和联系方式"及"例子和函数主体"等信息:
温馨提醒:Examples完成后,紧跟函数及其主体。这意味着整个函数包含的内容均要在这个以”.R"结尾的文件中。
- 需要下载包"roxygen2"、以及安装"Rtools"(https://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools)和"MikteX"(https://miktex.org)两个程序软件
开始创建R包
- 打开rstudio 按部就班:
点击file —> new project —> new directory —> R packages
对R 注意:在packages里的package name填写自己想要创建的R包名称;目录不需要改,默认路径会在电脑c盘"文档"创建对应函数名"文件夹",选中后确定。
成功后可以在C盘—>文档—>找到你自己创建的R包。
这一步将在该目录中创建以下文件(该目录为文档)。所有代码将存储在R 文件夹中,而手册和说明文件将储存在主文件夹中。
- 上述内容完成后关闭Rstudio; 以 rstudio 方式打开 DESCRIPTION 文件,编辑内容以准确地匹配包的描述。其他细节可以根据需要填写。
- R文件里放入已经编好的函数包括compare_revalue.R和cal_repeat.R并删除hello.R。
每个函数需要按照以下格式填好:(注意:#’ 后面的空格要存在)
- 将创建的包如DailyTools文件中除了已编辑好的如R文件夹内的文件和DESCRIPTION 文件,其余所有文件均删除。(只保留编辑过的文件,其它未编辑的文件全部删除。)
在Rstudio内完成R包构建
1)建立man文件和NAMESPACE文件
在R语言中设置该包所在的路径;设置为该包的"home";然后运行以下代码:
rm(list = ls()) # 清除当前环境所有变量
setwd(choose.dir()) # 这一步设置到文档即可
设置好路径后,如下图(正确打开方式):可以看到是一个~的路径,与刚刚创建R包名称那时的路径是一模一样的(切记)。
2)进一步构建R包
library("roxygen2")
roxygenize("DailyTools") # 对R包名进行构建
运行结果如下表明已经完成了Man和NAMESPACE两个文件的配置。如下:
3)在系统中创建包:
system("R CMD build DailyTools")
得到如下结果,表明创建成功:
4)检查R包(上传CRAN前的必经之路,不能有任何错误)
system("R CMD check DailyTools")
若该过程存在ERROR报错,请先删除R包中的man和NAMESPACE文件,并重新构建然后再依次步骤运行。
5)可选择创建PDF手册
system("R CMD Rd2pdf DailyTools")
6)最后进行本地安装R包
system("R CMD INSTALL DailyTools")
library(DailyTools)
?DailyTools::cal_repeat
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