python从属关系编号_通过Python从Pubmed获得的从属关系

我正在编写一个Python脚本(从here修改并在下面报告)在publibmed上搜索某所大学的论文数量，并下载合作者的从属关系。如果我运行代码，而不是我得到的从属关系。你知道怎么做吗？我该怎么做才能下载所有作者的从属关系呢？谢谢！在import urllib, urllib2, sys

import xml.etree.ElementTree as ET

def chunker(seq, size):

return (seq[pos:pos + size] for pos in xrange(0, len(seq), size))

query = '(("University of Copenhagen"[Affiliation]))# AND ("1920"[Publication Date] : "1930"[Publication Date]))'

esearch = 'http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi?db=pubmed&mindate=2001&maxdate=2010&retmode=xml&retmax=10000000&term=%s' % (query)

handle = urllib.urlopen(esearch)

data = handle.read()

root = ET.fromstring(data)

ids = [x.text for x in root.findall("IdList/Id")]

print 'Got %d articles' % (len(ids))

for group in chunker(ids, 100):

efetch = "http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi?&db=pubmed&retmode=xml&id=%s" % (','.join(group))

handle = urllib.urlopen(efetch)

data = handle.read()

root = ET.fromstring(data)

for article in root.findall("PubmedArticle"):

pmid = article.find("MedlineCitation/PMID").text

year = article.find("MedlineCitation/Article/Journal/JournalIssue/PubDate/Year")

if year is None: year = 'NA'

else: year = year.text

aulist = article.findall("MedlineCitation/Article/AuthorList/Author")

affiliation = article.find("MedlineCitation/Article/AuthorList/Author/Affiliation")

print pmid, year, len(aulist), affiliation

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