差异表达基因分析[转载]
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1.转录组
2.转录组研究重要性
3.转录组研究技术
3.1三种的比较
3.2技术比较
4.高通量测序技术的应用
5.转录组数据分析
6.差异表达基因分析
4.1FC法——差异表达倍数法
那么也就是说A与B是2倍的关系。
4.2卡方检验
7.假设检验存在的问题
7.1 t检验差异基因
我终于知道是怎么进行t检验找差异表达基因了,应该是聚类之后单细胞被确定为不同的细胞类型,那么将这些细胞类型子集中的每一个基因表达抽取出来,对每一个基因来说都能够形成一个向量,都会做一次假设检验;那么比如说有5种细胞类型,那么就第一组作为x1,其他4种分别作为x2,这样去做t检验,判断是否是差异表达基因。
7.2方差分析
8.趋势性上调或者下调
我的理解是,在判断差异基因的时候,调整FC的阈值,胡总和是相关系数的阈值,这样就会有得到更多或者更少的差异表达基因。
9.GO分析
转载于:https://www.cnblogs.com/BlueBlueSea/p/10129499.html
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