医疗图像坐标转换问题总结
对于3D0slicer上的数据,其dimention表示的是ijk坐标系下的。
例如如上图,数据的dimention是480480320。也就是i,j,k这个样子。那么i,j,k坐标系如何转换呢,我觉得要找个数据看一看,以上的数据,通过ijk变成ras后,显示如下:
那么可以得出i坐标轴,对应的应该就是R坐标轴。当对数据进行裁剪的时候,我们还是应该考虑转为IJK坐标系,也就是说我想裁剪左侧的下颌管位置,那么在I坐标轴下,其方向从原点到
imageNrrd = sitk.ReadImage(path)
print(imageNrrd.GetSize())
itkImage_arr = sitk.GetArrayFromImage(imageNrrd)
print(itkImage_arr.shape)
当用numpy获取到数组之后,这个维度就发生变化了。反过来了。
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