使用dcm4che对压缩的dcm文件进行解压

上一篇文章说到了DCM文件的无损压缩 DICOM DCM4CHE影像压缩

本想着压缩了就大功告成在使用的时候可以大大减少网络上传输的时间提高网站性能

但是新的问题又出现了

问题如下代码中获取文件像素的时候取到的是 null

    public static Attributes loadDicomObject(File f) throws IOException {if (f == null){return null;}else{DicomInputStream dis = new DicomInputStream(f);//attr.setSpecificCharacterSet("GBK");return dis.readDataset(-1, -1);}}
Attributes attrs = loadDicomObject(file);
byte[] pixelData=attrs.getBytes(Tag.PixelData);//pixelData 为null

但是在取没有压缩的DCM源文件通过这段代码是可以取到的

到底压缩和没压缩有什么区别呢？

先用阅片工具看一下PixelData 的tag吧

这是源文件的PixelData tag值

这是压缩后的PixelData tag值

很明显的 VR 从OW 变成了OB Value 变空了难怪取不上值

经过不断找资料研究发现DCM压缩后像素值会通过 Fragments 方式存

然后对代码进行修改

Object pixelData = attr.getValue(Tag.PixelData);
if (pixelData instanceof byte[]) {dicomPixels=(byte[])pixelData;
} else if (pixelData instanceof BulkData) {System.out.println("343434343");
} else if (pixelData instanceof Fragments) {Object [] aa= ((Fragments) pixelData).toArray();dicomPixels=(byte[])aa[1];
}

果然取上了压缩后的像素值

又想着终于解决了可以愉快的玩耍了结果新的问题又出来了

再用压缩后的像素值进行调节灰度时

居然这样了！！

居然马赛克了！

明显压缩后的源文件像素也应该是压缩处理了

然后继续研究。。但是确实资料太少了工期又有限

只好在用的时候先把压缩后的DCM文件先进行解压然后再获取像素值使用了

1.添加对应的dcm4che的jar包
在pom.xml里:

       <dependency><groupId>org.dcm4che</groupId><artifactId>dcm4che-imageio</artifactId><version>5.21.0</version></dependency><dependency><groupId>org.dcm4che</groupId><artifactId>dcm4che-imageio-opencv</artifactId><version>5.21.0</version><scope>runtime</scope></dependency>

开始解压

import java.io.File;
import java.io.FileOutputStream;
import java.io.IOException;
import java.io.OutputStream;
import java.nio.file.Files;
import org.dcm4che3.data.Attributes;
import org.dcm4che3.data.UID;
import org.dcm4che3.imageio.codec.Transcoder;public class Dcm4cheTranscode {public static void main(String[] args) {File src = new File("F:\\Desktop\\2238\\DX\\src.DCM"); //带有压缩协议的dicom原始文件File dest = new File("F:\\Desktop\\2238\\DX\\des.DCM"); //解压成未压缩的dicom目标文件try {transcodeWithTranscoder(src, dest);} catch (IOException e) {e.printStackTrace();}}public static void transcodeWithTranscoder(File src, final File dest) throws IOException {try (Transcoder transcoder = new Transcoder(src)) {transcoder.setDestinationTransferSyntax(UID.ExplicitVRLittleEndian);transcoder.setIncludeFileMetaInformation(true);transcoder.transcode(new Transcoder.Handler(){@Overridepublic OutputStream newOutputStream(Transcoder transcoder, Attributes dataset) throws IOException {return new FileOutputStream(dest);}});} catch (Exception e) {Files.deleteIfExists(dest.toPath());throw e;}}
}

目前是研究到这个份上，有更好的解决办法希望大神指点，我也会继续研究，不断学习的。。。有收获继续更新

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