如何快速寻蛋白PBD的ID

如何在PDB数据库快速查找一个目的蛋白的ID（以人的PCSK1为例)

先找去目的蛋白的序列，然后再去PDB数据库查询

找目的蛋白序列
1.1首先登陆NCBI数据库下protein子数据库，输入PCSK1（基因名），
1.2可找到上述两条目录，点击任意一条进入，这里我选择第一条，

1.3.进入页面后，修改格式为·FASTA,即可看到该蛋白序列
1.4 将蛋白序列拷贝下来，至PBD数据库的高级检索栏检索

PDB数据库网址：RCSB PDB: Homepage

2. 在PDB数据库页面，进入高级检索栏后如上图，选择sequence栏，将拷贝的蛋白序列粘贴，’display result as‘ 选择‘polymer Entities’,点击搜索按钮
3.结果如下图

左侧边栏有进一步选择物种，score一般降序，6EQX即为PBD的ID号。本次总共检索出24个，一般建议选择score 分值小的，具体原理还不太清楚。
4点击进去可查看该分子详细信息，1.994A即为score值。

5.也可下载后续分子对接分析等

如何快速寻蛋白PBD的ID相关推荐

7个地方可以帮助你快速寻找到你需要的代码
不管你是初学一门计算机语言或技术,还是想学习别人的经验和创意.做为一个开发人员,都会经常需要到搜索一些代码,下面是7个地方可以帮助你快速寻找到你需要的代码. GitHub Code Search 热门 ...
如何优化详情页快速促成转化[淘宝 ID 获取商品接口]
大家好,我是小编v兔.平台提供订单旗帜接口,备注接口,打单接口,发货接口.商品上架接口,下架接口,发布商品接口(支持多个电商平台)淘宝,抖音,拼多多,快手,等等. 我们都知道如何计算一个店铺的销售额, ...
Go Elasticsearch 删除快速入门
文章目录 1.根据 ID 删除 2.根据条件删除 3.批量删除 4.FAQ 4.1 elastic: Error 409 (Conflict) 参考文献本文借助第三方库 olivere/elasti ...
Go Elasticsearch 更新快速入门
文章目录 1.根据 ID 修改 2.根据 ID 修改(不存在则插入) 3.根据条件更新 4.批量更新 5.脚本更新 5.1 删除数组中的某个元素 5.2 删除数组中的多个元素参考文献本文借助第三方 ...
停车场寻车是怎么实现的？车库寻车有什么好办法？
随着机动车辆的不断增多,停车场的规模也在不断扩大,对于大型的停车场,由于停车场规模较大,这就带来了一个令停车客户很头疼的问题:当客户要去取车时,已经忘记自己把车辆停放在哪里了.开车寻找停车位,相信每一 ...
企企通聚源池| 聚合海量资源全网寻源，赋能供采双方撮合交易
目前,我们正处于一个飞速发展的信息时代,随着大数据时代的来临,在企业的日常经营中,数据无处不在,各类数据的采集.整合.分析对企业的发展.决策有着十分重要的作用. 数据管理作为企业一项重要的建设工作,对 ...
分子对接教程 | (4) 蛋白受体文件的预处理
TCGA | GEO | 文献阅读 | 数据库 | 理论知识 R语言 | Bioconductor | 服务器与Linux 接前文: 分子对接教程 | (1) 软件安装准备分子对接教程 | (2) ...
多尺度生成扩散模型预测蛋白-配体复合物结构的动态骨架
今天给大家介绍的是来自加州理工大学Zhuoran Qiao和NVIDIA团队发表在arxiv上的预印本<DYNAMIC-BACKBONE PROTEIN-LIGAND STRUCTURE PRE ...
分布式全局唯一 ID生成器(百度UidGenerator)
文章目录为什么要使用全局ID生成器? 使用UUID作为主键? 使用数据库主键自增? UidGenerator简介雪花算法snowflake SpringBoot整合百度UidGenerator 为 ...

如何快速寻蛋白PBD的ID

如何快速寻蛋白PBD的ID相关推荐

最新文章

热门文章