python中3D地形图展示16bit图像维度数据的工具包

可以像matlab一样展示图像数据维度，

为了用于在深度学习调试图片前处理时进行可视化，

并且解决了用plt.imshow图像不显示的问题（有人能告知一下到底怎么解决嘛，令人头秃)

可以展示全部，也可以只展示一部分（前200wh）

可以从路径展示图片，也可以从数据data展示图片

大于1200*1200+16bit图像的话，请谨慎使用展示全部

会非常慢

import tifffile
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
import os
import pylabdef visualize(image):# Divide all values by 65535 so we can display the image using matplotlibimage = image / 65535 *255plt.figure(figsize=(10, 10))plt.axis('off')plt.imshow(image)pylab.show()def visual_img_from_path(path,id=False):if id:image_ori=tifffile.imread(os.path.join(path,  id + '.tif'))else:image_ori = tifffile.imread(path)shape=image_ori.shapeprint(shape)#plt.imshow(image_ori)#x = np.arange(0, shape[0], 1)y = np.arange(0, shape[1], 1)X, Y = np.meshgrid(x, y)Z=image_ori[X,Y]fig = plt.figure()ax1 = Axes3D(fig)# ax2.set_aspect("auto")ax1.plot_surface(X,Y,Z, rstride=20, cstride=20,alpha=0.3, cmap=plt.get_cmap('winter'))# 设置图像z轴的显示范围，x、y轴设置方式相同ax1.contour(X, Y, Z, zdir='z', cmap="rainbow")  # 生成z方向投影，投到x-y平面ax1.contour(X, Y, Z, zdir='x', cmap="rainbow")  # 生成x方向投影，投到y-z平面ax1.contour(X, Y, Z, zdir='y', cmap="rainbow")plt.show()def visual_img_from_data(data):shape=data.shapeprint(shape)#plt.imshow(image_ori)#x = np.arange(0, shape[0], 1)y = np.arange(0, shape[1], 1)X, Y = np.meshgrid(x, y)Z=data[X,Y]fig = plt.figure()ax2 = Axes3D(fig)# ax2.set_aspect("auto")ax2.plot_surface(X,Y,Z, rstride=20, cstride=20, alpha=0.3,cmap=plt.get_cmap('summer'))ax2.contour(X, Y, Z, zdir='z', cmap="rainbow")  # 生成z方向投影，投到x-y平面ax2.contour(X, Y, Z, zdir='x', cmap="rainbow")  # 生成x方向投影，投到y-z平面ax2.contour(X, Y, Z, zdir='y', cmap="rainbow")# 设置图像z轴的显示范围，x、y轴设置方式相同plt.show()def visual_img_part_from_data(data):shape=data.shapeprint(shape)#plt.imshow(image_ori)#x = np.arange(0, 200, 1)y = np.arange(0, 200, 1)X, Y = np.meshgrid(x, y)Z=data[X,Y]fig = plt.figure()ax2 = Axes3D(fig)# ax2.set_aspect("auto")ax2.plot_surface(X,Y,Z, rstride=5, cstride=5, alpha=0.3,cmap=plt.get_cmap('summer'))ax2.contour(X, Y, Z, zdir='z', cmap="rainbow")  # 生成z方向投影，投到x-y平面ax2.contour(X, Y, Z, zdir='x', cmap="rainbow")  # 生成x方向投影，投到y-z平面ax2.contour(X, Y, Z, zdir='y', cmap="rainbow")# 设置图像z轴的显示范围，x、y轴设置方式相同plt.show()def visual_img_part_from_path(path,id=False):if id:image_ori=tifffile.imread(os.path.join(path,  id + '.tif'))else:image_ori = tifffile.imread(path)shape=image_ori.shapeprint(shape)#plt.imshow(image_ori)#x = np.arange(0, 200, 1)y = np.arange(0, 200, 1)X, Y = np.meshgrid(x, y)Z=image_ori[X,Y]fig = plt.figure()ax1 = Axes3D(fig)# ax2.set_aspect("auto")ax1.plot_surface(X,Y,Z, rstride=20, cstride=20,alpha=0.3, cmap=plt.get_cmap('winter'))# 设置图像z轴的显示范围，x、y轴设置方式相同ax1.contour(X, Y, Z, zdir='z', cmap="rainbow")  # 生成z方向投影，投到x-y平面ax1.contour(X, Y, Z, zdir='x', cmap="rainbow")  # 生成x方向投影，投到y-z平面ax1.contour(X, Y, Z, zdir='y', cmap="rainbow")plt.show()

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