windows php-beast安装,BEAST安装使用教程（Windows版）

简介

BEAST 2是用于分子序列的贝叶斯系统发生分析的跨平台程序。它使用严格或宽松的分子时钟模型来估计有根的，经过时间测量的系统发育。

它可以用作重建系统发育的方法，但它也是测试进化假设的框架，而无需以单个树形拓扑为条件。BEAST 2使用马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)在树空间上求平均，因此每棵树的权重均与其后验概率成正比。BEAST 2包括用于设置标准分析的图形用户界面和用于分析结果的一套程序。

下载beast

建议下载带java的版本，如果windows本地已有java环境，下载非java版本即可。

解压缩

使用解压缩工具解压缩BEAST_with_JRE.v2.6.2.Windows.zip即可，比如我们解压到了D盘，目录为D:\BEAST

配置Java

在windows下配置Java，就是设置系统环境变量即可，相关教程很多，下面还是赘述一下：

1.在开始菜单找到编辑系统环境变量

2.选择环境变量

3.在系统变量部分选择新建

4.输入变量名和变量值，如下图：

变量名：Java_Home

变量值：D:\BEAST\jre

5.修改Path环境变量，找到后选择编辑

6.在编辑环境变量页面选择新建

7.在输入位置写上Java的目录，然后点击确定

Java命令所在目录：%Java_Home%\bin

8.我们在选择新建，这次添加名为CLASSPATH的变量

变量名：CLASSPATH

变量名：.;%Java_Home%\bin;%Java_Home%\lib\dt.jar;%Java_Home%\lib\tools.jar

9.最后，我们点击确定即可。

运行Beast按快捷键Win+R，输入cmd，进入命令行

输入d:后回车，进入D盘

输入cd BEAST进入BEAST的解压目录

输入运行命令java -jar %Java_Home%\..\lib\launcher.jar .\examples\testBSP.xml，即可运行。

这里详细说明一下上图中3这一步的含义，

java 是运行java命令

-jar %Java_Home%\..\lib\launcher.jar 是运行名为launcher.jar的模块，其中的%Java_Home%是刚才在系统环境中设置的环境变量，这里不需要更改，因为这个BEAST的压缩包的目录结构就是这样的

.\examples\testBSP.xml是因为在BEAST文件夹下有一个examples文件夹，里面有一个testBSP.xml测试文件

运行其他算例：

打开cmd命令行

使用cd命令进入算例文件input.xml所在目录

运行java命令

1java -jar %Java_Home%\..\lib\launcher.jar .\input.xml

程序运行后如下图：

Linux版本

很久前写过Linux版本的使用方法，请参考：BEAST安装使用教程

windows php-beast安装,BEAST安装使用教程（Windows版）相关推荐

win8mysql安装教程zip_mysql 8.0.18.zip安装配置方法图文教程(windows 64位)
关于卸载以前安装版的数据库,大家可以参考一下这篇文章. 卸载前记住一定要记得复制保留以前的数据,安装版的数据是在 mysql5.7所有安装版本卸载教程,建议:大家卸载完一定要重启一下. 目录 1.先去 ...
python3.6.2怎样安装,python 3.6.2 安装配置方法图文教程
python 3.6.2 安装配置方法图文教程 Windows下Python(pip)环境搭建(3.6)图解,供大家参考,具体内容如下 1.下载最新的Python安装:3.6.2 2.安装时不要选择默 ...
mysql 8.0.18安装,mysql 8.0.18 安装配置方法图文教程
mysql 8.0.18 安装配置方法图文教程本文记录了mysql 8.0.18 安装配置图文教程,供大家参考,具体内容如下第一步:下载MySql 下载地址:MySQL 第二步:安装MySql 打 ...
Windows 服务器用IIS搭建网站详细教程
Windows 服务器用IIS搭建网站详细教程 Windows 服务器用IIS搭建网站详细小白级教程: 通常开通服务器后,需要进行网站搭建,下面是windows2003及2008系统搭建网站的操作方法 ...
TensorFlow2.0 系列开篇： Windows下GPU版本详细安装教程
点击上方"Datawhale",选择"星标"公众号第一时间获取价值内容 [导读]今年三月谷歌在TensorFlow开发者峰会上宣布TensorFlow 2.0 ...
mysql windows 管道连接,科技常识：Windows Server 2016 MySQL数据库安装配置详细安装教程...
今天小编跟大家讲解下有关Windows Server 2016 MySQL数据库安装配置详细安装教程 ,相信小伙伴们对这个话题应该也很关注吧,小编也收集到了有关Windows Server 2016 ...
windows安装gnvm安装教程,node多版本解决方案
windows安装gnvm安装教程,node多版本解决方案参考文章: (1)windows安装gnvm安装教程,node多版本解决方案 (2)https://www.cnblogs.com/liuz ...
Arduino可穿戴开发入门教程Windows平台下安装Arduino IDE
Arduino可穿戴开发入门教程Windows平台下安装Arduino IDE Windows平台下安装Arduino IDE Windows操作系统下可以使用安装向导和压缩包形式安装.下面详细讲解这 ...
Android 开发之Windows环境下Android Studio安装和使用教程(图文详细步骤)
鉴于谷歌最新推出的Android Studio备受开发者的推崇,所以也跟着体验一下. 一.介绍Android Studio Android Studio 是一个Android开发环境,基于Intel ...

windows php-beast安装,BEAST安装使用教程（Windows版）

windows php-beast安装,BEAST安装使用教程（Windows版）相关推荐

最新文章

热门文章