根据基因名、bed 文件的基因位置，提取 DNA 序列 bedtools

1、根据 Gene Symbol 查找在序列上的位置
2、根据基因位置提取参考上的序列

1、根据 Gene Symbol 查找在序列上的位置

从UCSC下载匹配的文件
链接: http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTables.

1）、主要注意版本的信息，按默认就行

2）、点击 get output，至下一页，就可以选择自己勾选自己想要的信息了

3）、下载后的文件，三列分别是 Transcription位置，Exon位置，geneSymbol

2、根据基因位置提取参考上的序列

bedtools getfasta -fi hg19.fa -bed target.bed > target.fa

bed 文件格式：

chr10    131265453   131565783

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