CUTTag PK ChIP-seq 技术
之前,弗雷德哈钦森癌症研究中心的Henikoff博士在Nature Communication公开了CUT&Tag技术的详细结果与实验方案。与以往的ChIP-Seq、pA-MNase等方法相比,CUT&Tag技术方法简便易行,信噪比高,重复性好,需要的细胞数量少至60个细胞,且有望将ChIP-Seq做到单细胞水平。
CUT&Tag技术的基本原理为:
在抗体引导下,ChiTag酶仅在目的组蛋白修饰标志、转录因子或染色质调控蛋白结合染色质的局部进行目的DNA的片段化,同时添加测序接头,并释放到细胞外。由于绝大部分无关的染色质还留在细胞核内,因此整个实验的信噪比大幅提高,同时简化了实验步骤。该方法可一管式高通量应用,并可与单细胞测序平台“无缝”结合。ChiTag酶在打断基因组的同时加上接头,不需要繁琐的补平加A加接头,在一天内可以完成从细胞到测序文库制备全流程。
CUT&Tag和ChIP-seq比较:
艾美捷CUT&Tag技术 科研工具:
EpiGentek的CUT&RUN和CUT&Tag技术。特别是 EpiQuik CUT&RUN M6A RNA富集试剂盒(P-9018)和EpiNext CUT&RUN M6A RNA-Seq试剂盒(P-9016),可以在zui小的非特异性背景水平上,从低输入RNA样本中特异性捕获和富集含有m6A修饰的RNA片段。富集的 RNA 特别适用于快速构建非条形码(单重)和条形码(多重)文库,允许以更小的偏差和高分辨率绘制 m6A 区域。
cat# 名称 时长
P-2028 EpiNext CUT&RUN Fast Kit <3小时
P-9018 EpiQuik CUT&RUN m6A RNA Enrichment (MeRIP) Kit <3小时
P-9016 EpiNext CUT&RUN RNA m6A-Seq Kit <6小时
P-2032 EpiNext cTIP (CUT&Tag In-Place)-Sequencing Kit <5小时
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