简介

表观遗传学是一种调控基因表达的可逆途径,通过DNA和组蛋白的化学修饰,决定特定基因是否能得以表达。表观遗传学调控多种生命活动及疾病发生发展,已成为近年来生命科学领域的研究热点,促使了生物学多领域研究的突破性进展。随着实验和测序技术的进步,当前产生了海量的表观基因组数据,从这些数据中挖掘生物学特征对理解生命的生理及病理过程有重要意义。如在癌症中,表观遗传学修饰的添加或删除,与肿瘤抑制基因的沉默或者癌基因的过表达有关。有研究显示,在标准的化疗流程之前先用表观遗传学药物处理癌细胞,可以增强这些细胞对抗癌药物的敏感性。

表观遗传学数据分析的意义

DNA甲基化分析:利用基于测序和芯片的技术定量研究基因组的甲基化模式。

DNA-蛋白质相互作用分析:深入了解蛋白质和DNA的相互作用,研究染色质修饰和局部结构改变对基因表达的潜在影响。

染色质可及性分析:使用ATAC-Seq评估基因组中的开放染色质区域,ATAC-Seq可对大量细胞群或单个细胞进行高分辨率的测序。

数据分析流程(甲基化数据)

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