《生物信息学》——李霞；；生信概念

挑战：寻找新的处理海量数据和复杂性的方法。

生信：
说了什么：

研究对象：以核酸、蛋白质等生物大分子数据库
研究手段方法：数学、信息学、计算机科学
研究工具：计算机硬件、软件、计算机网络

研究目的：对浩如烟海的原始数据进行获取、加工、存储、分配、分析、管理、注释解释，使之成为具有明确生物意义的生物信息。

并通过生物信息的查询、搜索、比较、分析，从中获取基因编码、基因调控、核酸和pro结构功能及其相互关系等理性知识。
在大量信息和知识的基础上探索生命起源、生物进化以及细胞、器官和个体的发生、发育、病变、衰亡等生命科学中重大问题，弄清它们的基本规律和时空联系。

是什么：

科学角度：研究生物(生物相关的)系统中“信息内容”和“信息流向”的综合系统科学。
工具角度：有关生物(医药)研究开发所必须的工具。
用处：临床诊断、检验、用药参考建议

怎么实现的：

在Linux系统上(操作各种数据处理软件)，利用prel or Python编程语言处理数据，存储在mysql or mongoDB
各种测序方法、一二三代测序原理、测序仪、操作流程

各种比对软件，及其参数设置、软件命令操作、输出结果解读(有用信息提取)，
各种格式的文件流程：下机数据格式.fasta/fastq --> 比对后格式.bam/sam --> 变异数据格式.vcf --> 注释文件.bed/gff/gtf

各种注释软件：
各种可视化工具：

数据挖掘、模式识别方法：
临床诊断、用药参考建议：

转载于:https://www.cnblogs.com/li-20151130/p/7457761.html

《生物信息学》——李霞；；生信概念相关推荐

perl语言入门第七版电子版_百迈客带您走近生信分析【入门篇】
年末促销倒计时:59天百迈客推出年末活动促销,发文有礼.推广有礼以及多种产品钜惠来袭,百迈客为您倾情打造科研福利,您还在等什么?快快行动起来领取您的超级奖励吧!(详情请见"决战2020!品 ...
生物信息学软件_生信软件操作视频教程大赛
楔子朋友圈偶然看到由信息中心生命科学图书馆联合营养与健康院团委.研究生会.中科院创新创业俱乐部举办的2019年度生物软件操作视频征集大赛,虽然是生物软件操作大赛,但是里面列出来的几乎都是生物信息学软 ...
计算机通路的基本概念,【生信学习笔记】KEGG分子通路数据库
原标题:[生信学习笔记]KEGG分子通路数据库首先什么是一个通路? 通路可以定义为a series of actions among molecules in a cell,细胞中的分子的一系列的行 ...
你想要的生信知识全在这——生信宝典目录 (181202)
生信的作用越来越大,想学的人越来越多,不管是为了以后发展,还是为了解决眼下的问题.但生信学习不是一朝一夕就可以完成的事情,也许你可以很短时间学会一个交互式软件的操作,却不能看完程序教学视频后就直接写程 ...
生信宝典联合科学出版社在双 11推出生物信息专题书单 5 折优惠！学起来！
系统学习一门知识还得靠书籍,如学习生信的系列书籍. 现在<科学出版社>在京东平台推出了正版专业图书大放价,权威的平台,高质量的书籍,系统的知识,何不搞起来? 机会难得,本来的优惠是 10 ...
免费Linux系统和生信宝典原创学习教程
生物信息的学习离不开Linux系统,不管自己写命令处理数据,还是使用现有的工具.Linux对我们来讲最重要的是它强大的命令行功能,可以快速.批量.灵活的处理数据的提取.统计和整理等耗时耗力的重复性工作 ...
生信工作流框架搭建 | 从零开始入门指南 - 00工作流之华山论剑
本篇为biodoge<生信工作流框架搭建>系列笔记的开篇作,该系列将持续更新. 导语小白生信工程师一枚,写这样的系列其实是个大工程,出发点很简单,工作是宏基因组相关,我司长期使用的流程p ...
生信宝典教程大放送，一站式学习生信技术
生物信息学包含生物数据分析.数据可视化.重复工作程序化,是生物.医学科研必备的技能之一.生信宝典精心组织生信学习系列教程.生信工具精品教程,通过大量的生信例子.关键的注释.浓缩的语句和录制的视频帮助快 ...
送书 | 知乎阅读300w+的生信学习指南（更新版）
先送书在上周的留言送书活动中,恭喜下面这位读者获得书籍"Oracle高性能系统架构实战大全",请及时与生信宝典编辑(shengxinbaodian)联系. 2020过去三分之一了 ...
生信数据库ID大总结-想踏入生信大门的你值得拥有
花了差不多一周写了这个总结希望对一些小伙伴有帮助目录各大生信资源的使用流行程度生信数据库的霸主-NCBI以及Entrez检索系统 Gene查找好帮手-Entrez Gene数据库人类基因命名 ...

《生物信息学》——李霞；；生信概念

《生物信息学》——李霞；；生信概念相关推荐

最新文章

热门文章