------------------------------ 会议------------------------
顶尖会议:
ISMB,每年1月投稿截止,7、8月开会,(奇数年在欧洲与ECCB合开、偶数年在美洲开)
ECCB,偶数年2月份左右投稿截止,8、9月开会
RECOMB,每年10月份左右投稿截止,3、4月份开会
一般会议:
APBC,每年8月份左右投稿截止,1月中下旬开会
BIBM、InCob

----------------- 期刊 --------------------------------

  1. Bioinformatics
    该期刊是生物信息学领域的顶级期刊,是CCF B类期刊也是SCI一区的,审稿速度也比较快。出版社是Oxford University Press的。近几年影响因子如下。
    不过今年的中科院分区竟然给他降级了。但不可否认它仍是生信信息学领域的顶刊。影响因子5.61。

BIOINFORMATICS杂志属于生物行业,“计算机:跨学科应用”子行业的顶级杂志。 投稿难度评价:虽然影响因子不是很高,但是也是行业的知名杂志,要求很高,投稿不太容易。

  1. Briefings in Bioinformatics
    该期刊是生物信息学领域的顶级期刊,是CCF B类期刊也是SCI一区的,审稿速度也比较快。
    在JCR分区和中科院分区都是一区期刊。18年文章量仅120篇,以双月刊的形式出版。审稿周期约2个月,版面费收取3308美金。接受率约25%,国人发文占比高达28%。
    对研究的原创性和创新性有较高要求,学术水平较高,发文有较高难度。也因此,浏览和参考其严谨的研究方法和文献等,
    平均审稿速度:网友分享经验:平均6月
    平均录用比例:网友分享经验:较难

出版社也是Oxford University Press的。近几年影响因子是比较高的了。影响因子:8.99

  1. IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics
    该期刊是CCF B类期刊,SCI三区的期刊,审稿速度较慢,时长都持续将近半年,但也有快的,大多数稿件速度较慢。影响因子稳步上升中。中科院分区实在不能看,让CCF脸皮何存。影响因子:3.015

  2. PLOS Computational Biology
    该期刊是CCF B类期刊,SCI二区,也是生物信息学领域的top期刊。影响因子:4.7

  3. BMC Bioinformatics
    该期刊是CCF C类期刊,SCI三区期刊,比较容易中,发文量也还不错。审稿速度也比价慢,看着分区,真的是CCF没脸面。影响因子:3,242

  4. BMC Genomics
    SCI二区期刊,发文量也比较多,审稿速度好像偏慢。影响因子:3.594

  5. Computational Biology and Chemistry
    SCI 四区期刊,影响因子:1.85。查了一下,感觉口碑不好

  6. BMC SYSTEMS BIOLOGY
    SCI 四区期刊,今年无影响因子,好像被踢出了

  7. Gene
    SCI三区期刊,影响因子:2.984

  8. Journal of Cellular and Molecular Medicine
    SCI二区期刊,

  9. Molecular Oncolog
    SCI二区期刊,影响因子:6.574

  10. Molecular Oncolog
    SCI四区期刊,影响因子:1.402

  11. Molecular Oncolog
    SCI二区期刊,影响因子:4.87

  12. Molecular Oncolog
    SCI四区期刊,影响因子:2.826

  13. IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics
    CCF C类,SCI二区期刊,影响因子:5.223,可以看出,今年被中科院称为了Top期刊。收少部分生信的文章。

  14. BioMed Research International
    SCI 四区,影响因子:2…276。年发文量比较大,但是审稿速度好像不快

  15. MDPI旗下的 (该出版社审稿速度超级快,但版面费较高,适合着急毕业的投,有些学校不太承认MDPI)
    (1)International Journal of Biological Macromolecules(影响因子:5,.16,SCI 三区)
    (2)Cells(影响因子:4.366, SCI 二区)比之前降了不少
    (3)molecules(影响因子:3.267, SCI 三区)
    (4)Genes(影响因子:3.759, SCI 三区)
    (5)Biomedicines(刚创刊不久,今年就会有影响因子)那么年发文量会有一个大的增长,可以投一下试试。

  16. Frontiers 旗下的 (该出版社审稿速度超级快,但版面费也挺高)
    (1)Frontiers in Oncology(影响因子:4.848,SCI 二区)
    (2)Frontiers in Pharmacology(影响因子:4.225.,SCI 二区)
    (3)Frontiers in Genetics(影响因子:3.258,SCI 三区)
    (4)Frontiers in Microbiology(影响因子:4.245,中科院二区,JCR一区)

  17. Genomics
    从SCI三区降到了四区,但是影响因子是真的高。影响因子:6.205。平均而言,大约在两个月即可接受

  18. International Journal of Biological Sciences
    SCI 二区,影响因子:4.858。网上说审稿速度:平均一个月。

  19. molecular therapy-nucleic acids
    SCI 二区,影响因子:7.032。审稿速度不确定,有较快的也有较慢的

  20. neurocomputing
    SCI 二区,CCF C类期刊。影响因子:4.438 Frontiers of Computer science

  21. Frontiers of Computer Science
    SCI 三区,CCF C类期刊,影响因子:1.275

CCF B类会议

  1. PLoS One
    SCI 三区,影响因子:2.74

  2. OncoTargets and Therapy
    SCI 三区,影响因子:3.337。影响因子稳步上升,审稿速度快,国人友好,生信文章友好。

  3. Cancer Control
    SCI 四区,影响因子:3.103。评价还不错

  4. Current Bioinformatics

  5. Molecular Therapy-Nucleic Acids

  6. IEEE Transactions on Neural Networks and Learning Systems(最近看到一篇生信文章发在上面)挺好的期刊

  7. Knowledge-Based Systems

1、 IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 3.015
中科院分区表3区,CCF B类期刊
审稿速度:4.0
经验分享:现在是ccf-b类期刊了。 期刊的高难度与其低影响因子成反比,,感觉好难中。
审稿速度:6.0
经验分享:交叉学科的刊,基于深度学习方面还是挺好发的。

2、 Bioinformatics 5.610
BIOINFORMATICS杂志属于生物行业,“计算机:跨学科应用”子行业的顶级杂志。 投稿难度评价:虽然影响因子不是很高,但是也是行业的知名杂志,要求很高,投稿不太容易。
中科院分区表3区

3、 Computational and Mathematical Methods in Medicine 1.770
中科院分区表4区
平均审稿速度:网友分享经验:一般,3-6周
平均录用比例:网友分享经验:容易

4、mSystems 6.633
中科院分区
大类:生物 2区
小类:微生物学 2区
经验分享:2次小修后accept,审稿人意见一般,死扣细节,感觉有点水
审稿速度超慢,大约2个月,非常耽误事
经验分享:要求较高,要求数据量大,能充分支撑结论。
投稿经验:
1,生信文章已发表。
2,到editor手上很快 就是reviewer审稿较慢,第一次审稿三个月后被拒了,但是我们的数据较大所以editor修稿后可以重投,给我们留了重投的渠道。
3,于是修改后又重投,每次审稿周期都在两个月左右,前后一共返了四次。
第一次投稿到发表,一共经历了一年又2个多月,周期有点长。
4,一共找了两个reviewer一个偏向技术 一个偏向科学问题,还是挺专业的。
5,但好在这个杂志的影响因子一直在上升,口碑也很好,所以整体来说,质量还是可以。
如果赶时间发表不建议投该杂志。

5、 BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS 8.990
在JCR分区和中科院分区都是一区期刊。18年文章量仅120篇,以双月刊的形式出版。审稿周期约2个月,版面费收取3308美金。接受率约25%,国人发文占比高达28%。
对研究的原创性和创新性有较高要求,学术水平较高,发文有较高难度。也因此,浏览和参考其严谨的研究方法和文献等,
平均审稿速度:网友分享经验:平均6月
平均录用比例:网友分享经验:较难

6、 Frontiers in Microbiology 4.236
中科院分区
大类:生物 2区
小类:微生物学 2区
审稿速度:1.0|投稿命中率:25.0|版面费用:2950.0
经验分享:肠道微生物方向,做实验带写文章快折腾了2年。10月份,一开始投mbio被拒了,11月中旬改投的FM. 差不多一个月时间拿到三个审稿人的意见,除了其中一个意见有二十多条,其他两个人都是提了四五十条以上的修改意见,万幸没有让补充试验。目前还在焦急等待中。
之前听朋友说FM很好投,而且看了一些前几年的文章感觉有的确实很一般。不过现在看也没那么容易。希望杂志努努力明年也能进到1区吧。
审稿速度:3.0
经验分享:投稿综述大的修改后已被接收,感觉很专业。
最近学校提出这个杂志被警示了,不知其它学校有无这种情况,感觉不应该啊,if也在增加,今年预计4.40-4.50

7、 PLoS Computational Biology 4.428
中科院分区
大类:生物 2区
小类:生化研究方法 2区|数学与计算生物学 1区
PLOS COMPUT BIOL 在该细分领域可能是国际一流杂志,但是国内关注少,可能与很难投中有关吧,可以试试,但不要报过高中的期望哦。
目前计算生物学领域认可度较高的期刊,第一次投稿被编辑秒退,第二次投稿修改一次后被录用了。期刊对论文内容、方法、表述要求相当高,每年发表论文数目比较稳定,国内论文比较少。每年的影响因子不是很高,比较稳定
计算系统生物学领域的顶级期刊,比较小众,但在学术同行的认可度和含金量很高。
数学与计算生物学领域最受认可的杂志。更bioinformatics在风格上稍有不同,更强调生物学意义。中国学者(包括合作署名)在pcb上发表论文的比例不足5%. 而bioinformatics为15%以上。可见在pcb上发表论文的难度。
作为中科院二区的期刊,看重文章新颖性。该期刊接收率50%,自引率5.7%,版面费2350美元,国人发文占比4%,年文章量600+,相关研究方向的粉丝可以尝试投稿。综合该期刊,投稿命中率高达50%,影响因子稳定。

8、 BMC BIOINFORMATICS 3.242
中科院分区
大类:生物 3区
小类:生物工程与应用微生物 3区|生化研究方法 3区|数学与计算生物学 2区
与相似领域的其他的期刊相比,BMC Bioinformatics的命中率达55%,且审稿周期也较短,一般4周左右就能返回,
2020.4.26 投递
2020.5.31 一审意见下来
2020.6.12 一审修改后投递
2020.7.23 录用
每次投文章都是几经周折,这篇文章在2019年8月份就开始投递了,只不过被拒了,编辑说修改后可以重新投递。之前投的时间如下:
2019.8.25 投递
2019.11.15 直接被拒
然后花了大半年修改后又重新投。关注生信算法可看审稿意见,谢谢。
总的来说,BMC Bioinformatics是一本发文量多、命中率高、审稿速度在34个月,值得23分的生信文章首选投稿的期刊

9、OMICS-A JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOLOGY 2.529
中科院分区
大类:生物 3区
小类:遗传学 4区|生物工程与应用微生物 3区

10、GENOMICS 6.205
在中科院分区中,Genomics期刊属于生物学大类3区,生物工程与应用微生物小类3区,遗传学小类3区;
在审稿速度方面,Genomics期刊表现相当优异。根据期刊官网显示,该刊对过去几年论文发表的速度进行了统计,平均8周左右就能接收,最快几天就能完成投稿。

11、Scientific Reports 3,998
中科院SCI期刊分区
( 2020年12月最新升级版)
大类学科 小类学科 Top期刊 综述期刊
综合性期刊3区
MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
综合性期刊 3区
是机器学习和癌症检查的结合。估计是editor在网上看我发过类似的方向,找的我吧,之前没联系过。
这篇论文可以说完全没有创新性,就是用sklearn里面的模型在癌症数据库上跑了下,调调参,类似的论文都烂大街了。工作量不能说没有,但整体都是苦活,至少从机器学习这个方向来说是没有任何贡献的。如果要修改,也就是整篇论文推翻从来,这跟拒稿没有区别。

12、BIOCHIMIE 3.413
中科院大类分区 生物:3区
中科院小类分区 生化与分子生物学 3区
平均审稿速度:网友分享经验:较快,2-4周
来源Elsevier官网:平均7.8周
平均录用比例:网友分享经验:较易
来源Elsevier官网:39%

13、BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 2.985
中科院分区
大类:生物 3区
小类:生化与分子生物学 4区|生物物理 3区
2019.3.29文章投出,4.3分配了手稿号,4.7决定直接录用,非常迅速。该期刊特点是无论接收还是拒绝都恢复迅速,比较适合即将毕业的人员赶时间选刊。期刊涉及研究领域比较宽泛,医学,生物学,药物化学等交叉学科,为不同研究类型都提供了空间。
第一次投拒了,但是意见里说删减内容可以重投
按要求改好后投回去,5天接收。
实际发生于2019-6.
最近投了,直接拒。理由:数据扎实但是领域过于小,不能引起广泛的关注。

14、JOURNAL OF THEORETICAL BIOLOGY 2.327
中科院分区
大类:生物 4区
小类:数学与计算生物学 3区|生物学 3区
平均审稿速度:网友分享经验:平均3.0个月
来源Elsevier官网:平均14.2周
平均录用比例:网友分享经验:约50%

15、Journal of Translational Medicine 4.098
中科院分区
大类:医学 2区
小类:医学:研究与实验 2区推荐理由:1.2020年接收纯生信文章;2. 年发文量一般(424篇);2. 对生信文章的发文的工作量和可视化程度要求都不高
年刊文量一直都很稳定,基本维持在300多篇
因此,国人在该刊上发表文章的数目正在逐年增加,占据的比例超过40%。由此可见,该刊对国内学者比较友好,而且也逐渐深得国人之心。

16、International Immunopharmacology 3.943
中科院分区
大类:医学 3区
小类:药学 3区|免疫学 3区
平均审稿速度:网友分享经验:平均2.7个月
来源Elsevier官网:平均7.5周
平均录用比例:网友分享经验:约81.66%

17、International Journal of Molecular Sciences 4.556
中科院分区
大类:生物 2区[Top]
小类:化学综合 3区|生化与分子生物学 3区
一个月内接受,效率确实高,送审很快,但是审稿过程还是严谨仔细的,对文章质量提升有所帮助。汤森路透jcr一区了,没以前好投了,需要有所创新,较完整的实验验证,原始实验数据和图片,一定的工作量,合乎4分 期刊的要求。

18、BioMed Research International 2.276
中科院分区
大类:生物 3区
小类:医学:研究与实验 4区|生物工程与应用微生物 3区
审稿速度:3.0|投稿命中率:75.0|版面费用:2200.0
偏重的研究方向:肿瘤诊断及预后
1月6日投稿; 9月2日修回; 9月8日接收; 9月21日online,中间催了四次稿,后来只给了两个不痛不痒的的意见,很不专业,也是不等着文章用,建议慎投!
审稿速度是真的慢,几个月后给你来一句没找到审稿人

19、J CELL PHYSIOL/JOURNAL OF CELLULAR PHYSIOLOGY 5.546
中科院分区
大类:生物 2区
小类:细胞生物学 3区|生理学 2区
平均审稿速度 网友分享经验:平均1.0个月
平均录用比例 网友分享经验:较难
属于生物行业,“生理学”子行业的优秀级杂志。 投稿难度评价:中等偏上杂志,要求也较高,此区杂志很多,但是投中,并不容易 审稿速度:较快,2-4周
审稿速度:3.0|投稿命中率:50.0
经验分享:非常支持期刊今年七月才出的要求提供所有原始图片及wb的marker等,这是一本对中国人很友好的期刊,影响因子也不错,已经出现了一次造假文章被撤的事件,再来一次可能真的就要被SCI除名了,到时候所有人都要凉凉了。所以国人们请谨慎灌水

20、Computational Biology and Chemistry 1.850
中科院分区
大类:生物 4区
小类:计算机:跨学科应用 4区|生物学 4区
审稿速度:7.0
经验分享:这个期刊速度很慢很慢,大家谨慎投,

21、Journal of Cellular and Molecular Medicine 4.486
中科院分区
大类:医学 2区
小类:细胞生物学 3区|医学:研究与实验 2区
JCMM杂志主要关注生理学、细胞医学、分子生物学等,以下方向的研究也均可投稿尝试,包括:
病理学、药理学、公共卫生、实验医学、心血管病学、心脏病学、癌症、组织工程学、神经科学、生物化学、干细胞、基因组学、小分子核糖核酸、蛋白质组学、细胞凋亡、阿尔茨海默病、再生医学、表观遗传学、脓毒症等。
投稿经验
由于有人指出该刊可能被剔除SCI,因此,我也在网上找到了一些学者的看法和投稿经验。发现还真有不少学者担心该刊会被踢,甚至还有学者造谣该刊已经被踢。
特意查询了一下JCMM期刊,发现该刊还被收录在SCI数据库,
虽然国内学者论文占比越来越高,而且版面费也略贵,但是该刊自引率很低,影响因子维持在4分+,并且没有太大幅度变化。
因此,总体来说JCMM期刊近几年应该不会被剔除SCI。
但是既然众多学者提出来,说明该刊还存在一些问题,各位投稿者也需要谨慎对待。

22、PLoS Computational Biology 4.700
中科院分区
大类:生物 2区
小类:生化研究方法 2区|数学与计算生物学 1区
平均审稿速度:网友分享经验:平均3.0个月
平均录用比例:网友分享经验:很难

23、IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics 5.223
中科院SCI期刊分区
( 2020年12月最新升级版)
大类学科 小类学科 Top期刊 综述期刊
工程技术2区
MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
数学与计算生物学 1区
MEDICAL INFORMATICS
医学:信息 1区
COMPUTER SCIENCE, INFORMATION SYSTEMS
计算机:信息系统 2区
COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS
计算机:跨学科应用 2区
一审大约一个半月
三个审稿人,编辑给了大修
大修改完投出去一个月返回小修意见
小修改完投出去一个月返回接收
总的来说:很好地期刊,负责的态度
投稿经验:
大修7个审稿人,提了很多修改意见,修改了两个多月后返回。后面又经过了两轮小修后接收。
总体来说,虽然过程比较曲折,但是审稿速度很快,编辑也很负责。希望期刊越办越好。

24、Journal of Biomedical Informatics 3.526
中科院分区
中科院分区表对汤森路透每年度发布的期刊引证报告(JOURNAL CITATION REPORTS,简称JCR)中SCI期刊在学科内依据3年平均影响因子划分分区。它包括大类分区和小类分区:大类分区是将期刊按照自定义的13个学科所做的分区,大类分区包括Top期刊;而小类分区是将期刊按照JCR已有学科分类体系所做的分区。
大类:医学 3区
小类:医学:信息 3区|计算机:跨学科应用 3区
经验分享:不错的期刊,生物信息学类里面比较好的。
审稿速度:2.0
经验分享:2019年11月19投出。
2020年1月24外审。
2020年3月13通知大修。
2020年4月1号逐条答复修改意见并提交大修到系统。
2020年4月25号收到录用通知。

总结
生物信息学毕竟是和生物的交叉学科,如果解决的生物问题前沿也可以投nature子刊这种。生信包括做算法的,也有包括单纯辅助生物研究的,两着的侧重点不同,投的期刊也可以侧重点不同。

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