NBR:Network-Based R-Statistics using Mixed Effects Models
基于Zalesky在2010年发表的文献,文献地址:
doi:10.1016/j.neuroimage.2010.06.041

NBR一共包括6个函数,如下:

frontal2D
这是一个预设的数据集,如下:


这是一个包含24个病人,24个健康人的数据,变量有group、sex、age和一些节点数据,FAG.FAD是节点FAG和节点FAD之间的功能连接度,一共有381-3=378列,由此可以推出这个地图集是28个label(自身跟自身的去掉)。
nbr_lm: 线性模型的NBS
此函数用于计算网络中每条边的指定线性模型(LM),并计算已连接边簇大小的族误差(FWE)p值分别低于P阈值(thrP)或高于T阈值(thrT)。WE估计是基于关于连通边集(定义如上)的最大大小的零分布,得到使用原始数据的nperm置换。

Usage
nbr_lm(net, nnodes, idata, mod, diag = FALSE, nperm,
thrP = 0.05, thrT = NULL, cores = NULL,
nudist = FALSE, expList = NULL, verbose = TRUE,
...)


举例:

nperm就是置换的次数,一般是5000次,第一次使用的时候建议用5次,以防止矩阵的格式不对。
输出如下:

nbr_lme交互效应模型的NBS,用法同nbr_lm
nbr_lm_aov
此函数用于计算中每个边的指定(非线性)线性混合模型(LME)方差分析
网络,并计算簇大小的族误差(FWE)p值单独低于P阈值(thrP)或高于F阈值(thrF)的连接边。FWE估计是基于连通边集最大尺寸的零分布(定义如上所述),通过原始数据的nperm置换获得。

Usage
nbr_lme_aov(net, nnodes, idata, mod, rdm, diag = FALSE,
nperm, thrP = 0.05, thrF = NULL, cores = NULL,
nudist = FALSE, expList = NULL,
verbose = TRUE, ...)
nbr_result <- nbr_lme_aov(net = voles[,-(1:3)],
nnodes = 16, idata = voles[,1:3],
mod = "~ Session*Sex",
rdm = "~ 1+Session|id",
nperm = 5, na.action = na.exclude
)
show(nbr_result)

交互效应模型用法同线性模型。
over

介绍NBR: Network-Based R-Statistics using Mixed Effects Models相关推荐

  1. 毫米波目标检测论文 阅读笔记 | Radar Transformer: An Object Classification Network Based on 4D MMW Imaging Radar

    毫米波目标检测论文 | Radar Transformer: An Object Classification Network Based on 4D MMW Imaging Radar Jie Ba ...

  2. Item Tagging for Information Retrieval: A Tripartite Graph Neural Network based Approach 用于信息检索的项目标签

    文章目录 摘要 简介 Tagging 方法 动机和总览 动机 总览 TagGNN-IT 节点表示 TagGNN-IT Propagation 损失 2.3 TagGNN-QI 2.3.1 边表示 2. ...

  3. 论文笔记(SocialGCN: An Efficient Graph Convolutional Network based Model for Social Recommendation)

    一个有效的基于图卷积神经网络的社交推荐模型 原文链接:SocialGCN: An Efficient Graph Convolutional Network based Model for Socia ...

  4. Paper翻译:《A Novel Convolutional Neural Network Based Model for Recognition and Classification of App》

    论文名称:<A Novel Convolutional Neural Network Based Model for Recognition and Classification of Appl ...

  5. 论文笔记7:Image Blind Denoising With Generative Adversarial Network Based Noise Modeling

    Image Blind Denoising With Generative Adversarial Network Based Noise Modeling 引言 相关工作 基于GAN-CNN的盲去噪 ...

  6. 图像分割——Multi-Scale and Pyramid Network Based Models( PSPN)理解和代码分析

    Multi-Scale and Pyramid Network Based Models 简介: 多尺度分析(Multi-scale analysis)是一个比较古老的算法,他的主要思想是,通过自适应 ...

  7. 读论文《Recurrent neural network based language model 》

    读论文<Recurrent neural network based language model > 标签(空格分隔): 论文 introduce 本文将循环神经网络RNN引入了神经网络 ...

  8. Convolutional Neural Network based Multiple-Rate Compressive Sensing for Massive MIMO CSI Feedback:

    Convolutional Neural Network based Multiple-Rate Compressive Sensing for Massive MIMO CSI Feedback: ...

  9. 零基础自学R语言 1 R语言介绍 1.4 基本R软件的用法

    零基础自学R语言 文章目录 零基础自学R语言 1 R语言介绍 1.4 基本R软件的用法 1.4.1 基本运行 1.4.2 项目目录 1 R语言介绍 1.4 基本R软件的用法 1.4.1 基本运行 在M ...

最新文章

  1. String性能提升10倍的几个方法!(源码+原理分析)
  2. 蓝桥杯单片机十一届省赛_“第十届蓝桥杯青少组C++省赛”前三题解题思路及参考答案!...
  3. 开放下载!《iOS开发者必读资讯》
  4. 还有人不知道什么是AndroidX的吗?文末领取面试资料
  5. 红旗linux系统可以运行QQ吗,如何在红旗Linux系统redflag6.0上安装QQ
  6. android.opengl.GLSurfaceView.Renderer概述
  7. html搜索框 模糊搜索,前端js模糊搜索(模糊查询)
  8. android退出一个含有listview的activity时报java.lang.IllegalA
  9. 别人工作2年半跳槽面试阿里,成功拿到offer,为什么你不可以?
  10. from .import xxx什么意思
  11. 基于python的毕业设计仓库库存管理系统
  12. 项目管理工具——5W1H分析法
  13. 轻量级Kubernetes k3s初探
  14. OpenDaylight VTN 项目指南
  15. 秀动app抢票脚本_GitHub标星2.5万的quot;Python抢票教程”!
  16. 微信分享,获取分享点击事件,登录后才可以分享
  17. LaTex 美赛笔记
  18. 搭建个人网站---域名+解析+github
  19. linux脚本 set env,shell文件中set setenv source
  20. 在vue中使用turn.js

热门文章

  1. DHCP服务器的开始方式
  2. python之路-day33-线程相关1
  3. 记一次线上部署cpu占用大的问题分析
  4. 为什么32 >> 32等于32
  5. 【学习笔记】数据库技术
  6. 闪客工具:HBuilder
  7. wap2app 安卓返回键 直接退出问题
  8. 第59讲:Python编程案例之舍罕王赏麦
  9. outlook POP3 IMAP设置
  10. 自媒体视频如何“伪原创”?九大技巧揭秘!