R语言之长宽数据转换

之前计算物种和抗性基因之间的相关性的时候得了一些宽数据，如下，这里想把它转换为长数据。

这里使用两种方法：

Tidyr包中的gather函数

data <- read.csv("R.csv")#这里直接读入数据第一列的数据直接也包含在了数据中，方便后续直接选定不进行聚合，结构如下图1
R_long <- gather(R,key = "species",value = "value",-'x')#这里默认聚合的是所有的列名，聚合后命名为species，其他所有的数值被聚合到value列，-‘x’是表示不对x进行聚合,结果如图2

图1

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图2

Reshape2包中的melt函数

data <- read.csv("R.csv")#和上文一样的解释
R_long <- melt(R,id.vars=c("X"))#这里只需要对X变量进行聚合即可，其他的按照melt函数的默认规则运行即可，结果和上文中的结果一致。

其他更为详细的介绍

这里博主只进行了简单的描述，详细的使用过程各位可以参考这篇博客：R包reshape2 |轻松实现长、宽数据表格转换 - 云+社区 - 腾讯云 (tencent.com)

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Tidyr包中的gather函数

Reshape2包中的melt函数

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