杨勇在国际上首次发现SCN9A是一种疼痛相关疾病的致病基因,后来老外follow他的研究发了Nature。具体可查看饶毅的这篇推文:中国发现人类疾病基因的两个重要贡献。

本篇致敬前辈,在上述推文的基础上,进一步分析该基因的蛋白结构,试图解释其分子机制

杨勇教授与SCN9A

红斑肢痛症是一种罕见的常染色体显性遗传病,以间歇性灼痛为特征,四肢发红发热。杨勇教授首次提出SCN9A突变是红斑肢痛症的致病原因,导致SCN9A功能增强,从而对伤害刺激更敏感。SCN9A基因编码Nav1.7蛋白,是痛觉特异的离子通道。这一工作既揭示了一个疾病的致病基因,同时提出了疼痛的一个特异机理,而且抑制Nav1.7钠通道可能成为治疗慢性疼痛的一个新方案。

SCN9A的蛋白结构和致病机制探讨

杨勇教授发现的SCN9A基因 (下图绿色)其中一处突变c.T2543C (p. I848T),会导致Nav1.7通道的电压敏感度增加,并可能导致患者痛觉的增加。I848T (下图红色)突变的位置似乎对Nav1.7的门控至关重要,是通道门打开和关闭的关键。

聊生信绘制

I848T可被PKC磷酸化,可以影响NAV通道,这种翻译后修饰可能对超敏反应的启动很重要。T848残基位于细胞内,位于结构域II的S4-S5连接位点,使其可与激酶结合。因此,这个Nav1.7突变体在通道蛋白中创建了一个新的磷酸化位点。可以导致电压依赖性激活的超极化 (A hyperpolarization in the voltage dependence of activation)。

本课程提供详细的分析方法:

第二期临床基因组家系数据分析实战,快速发表SCI文章

SCN9A的三维结构

在磷酸化的T848残基附近鉴定出四种苯丙氨酸。距离足够近,大多数苯环都能发生π-相互作用。所有四种苯丙氨酸在人类和其他几个物种中都高度保守。这表明这些苯丙氨酸起着重要的作用,而且,与这些残基的任何分子相互作用都很容易影响通道功能。

SCN9A的多序列比较

磷酸化的T848残基上的负电荷可能与周围的苯丙氨酸发生弱相互作用 (阴离子-π相互作用),或者是苯丙氨酸芳香环的部分负表面排斥T848残基的负电荷,可能会影响电压灵敏度。

I848T残基可以与周围的苯丙氨酸相互作用

而I848K和I848R突变体的无功能性可能也强调了848位点对正常通道功能的重要性,由于阳离子-π相互作用是最强的非共价相互作用之一,848位点的正电荷将与周围的苯丙氨酸发生更强的相互作用。可以想象,如此强烈的相互作用将使通道完全不起作用。

综上,SCN9A (p.I848T)的磷酸化可以导致电压依赖性激活的超极化。这增加了通道的电压敏感度,并可能导致患者痛觉的增加,这种磷酸化是由PKC引起的。T848磷酸化引入的负电荷可以与周围的苯丙氨酸发生π-相互作用,这可能介导了电压敏感性的变化。

杨勇教授简介

杨勇,中国医学科学院皮肤病医院主任医师,教授;曾任北京大学第一医院皮肤科主任医师,教授,中国医师协会皮肤科医师分会罕见病组组长,中华医学会皮肤性病学分会遗传学组副组长。国家杰出青年基金获得者;北京大学-清华大学生命科学中心临床研究员。主要从事遗传性皮肤病的临床和实验室工作以及皮肤生物学研究。主要研究成果包括:2002年带领课题组完成国内首例遗传性皮肤病的产前诊断,至今已完成了包括着色性干皮病、板层状鱼鳞病、大疱性表皮松解症等的百余例次产前诊断,在数十种单基因遗传性皮肤病的数百个家系中实施了基因突变检测;2004年起带领课题组在国际上首次探明原发性红斑肢痛症等7种疾病的致病基因。

参考文献

https://mp.weixin.qq.com/s/vZ_SdAvXcL95o_QWJgQjzQ (饶议科学)

https://www.haodf.com/doctor/3326/xinxi-jieshao.html (杨勇教授简介)

Yang, Y., Wang, Y., Li, S. et al. (2004). Mutations in SCN9A, encoding a sodium channel alpha subunit, in patients with primary erythermalgia. Journal of medical genetics, 41(3), 171-174.

Kerth, C. M., Hautvast, P., Körner, J. et al. (2021). Phosphorylation of a chronic pain mutation in the voltage-gated sodium channel Nav1. 7 increases voltage sensitivity. Journal of Biological Chemistry, 296.

—   基本概念 —

外显子和基因组基本概念(一)

外显子和基因组基本概念(二)

蛋白质生物学推介(一)

蛋白质生物学推介(二)

蛋白质生物学推介(三)

蛋白质生物学推介(四)

蛋白质生物学推介(五)

—   文献解读  —

一个家系突变分析一篇 SCI | 文章解析

全基因组测序有助于诊断更多的罕见病

整合基因组学和蛋白质结构的致病机制分析

JMG | 基因PRKG2的变异导致骨骼表型异常

JGG | LRP6变异与渗出性玻璃体视网膜病变

基因突变与脑瘫风险(Nature Genetic,2020)

全外显子测序显示COQ8B基因新的纯合突变与肾病综合征有关

IF>10 家系研究 | OGDHL变异导致神经发育谱系疾病,表现为癫痫、听力与视力障碍等

—   数据库  —

ClinVar数据库详解

AlphaFold数据库简介

gnomAD数据库简介(一)

gnomAD数据库简介(二)

国际千人基因组计划数据库(一)

国际千人基因组计划数据库(二)

在线人类孟德尔遗传 (OMIM)数据库简介

—   期刊  —

人类遗传学领域期刊速览

AJHG | 人类遗传学领域一流期刊

国产好刊 | 中科院遗传学一区JGG

—   分析技术  —

Sanger测序拼‍接

BAM文件格式解读

Trim Galore软件详解

346个基因组可视化工具一网打进!

基因组浏览器IGV的安装和图形解读

利用IGV可视化基因组遗传变异位点

Jalview多序列比对图中显示序列标识

蛋白质二级结构、结构域及蛋白修饰预测

多序列比对软件Jalview的安装及使用体验

正常与突变蛋白三维结构模型的绘制与分析

分子结构模拟工具UCSF Chimera安装及操作

—   分析平台  —

Linux操作系统结构及常用命令

服务器 | 查看操作系统重启日志

设置RStudio-Server不频繁掉线

RStudio-Server安装和内网穿透要点

Linux服务器的磁盘概念与相关操作 (一)

Linux服务器的磁盘概念与相关操作 (二)

—   理论与技术培训  —

临床基因组家系数据分析实战,快速发表SCI文章

转录组分析和可视化的正确姿势你知道了吗?

—   遗传咨询  —

遗传性肾脏病的基因检测

—   政策法规  —

雇人代写论文是否犯法?

中华人民共和国人类遗传资源管理条例

—  Tales of Genetics  —

巴黎保姆

60亿人,60亿组碱基对

一个突变基因保护了欧洲人祖先

高中学历父亲自学基因编辑,看五六百篇论文,自制药用级化合物救治罕见病儿子!

欢迎咨询全固态大型云服务器租用

1周内完成家系变异生信分析,尽快推进下游分析

更适合家系全外显子组

若有服务器亦可免费技术咨询,提供力所能及的解答

一/二代测序、临床基因组/外显子组/转录组、遗传学分析

  

第二期临床基因组家系数据分析实战,快速发表SCI文章

系统性培训,一次学会终身会分析,只待新病例

服务器免费1个月,每日答疑,足以完成小家系分析

这个中国人首次在国际上报道了一个新的致病基因,老外follow他的研究发了Nature...相关推荐

  1. 团队管理新思考_需要一个新的空间来思考讨论和行动

    团队管理新思考 andrew wong安德鲁·黄 Follow跟随 Sep 4 九月4 There is a need for a new space to think, discuss, and a ...

  2. 媒体报道|香港科大(广州)创校校长倪明选:“接下来的30年,我们希望再创造一个新的历史”...

    30年前,在香港科技大学创校的一批老师创造了奇迹,把香港科大打造成了世界一流的学校.接下来的30年,我们希望再创造一个新的历史. 5月17日下午,香港科技大学(广州)(下简称香港科大(广州))创校校长 ...

  3. 知识工程学:一个新的重要研究领域

    知识工程学:一个新的重要研究领域 黄荣怀 (北京师范大学网络教育实验室 100875) 李茂国 (教育部高等教育司100816) 沙景荣 (北京师范大学网络教育实验室 100875) 摘要 知识工程是 ...

  4. 对抗人脸识别的一个新方法:隐藏身份、随机换脸

    作者:杨晓凡 来源:AI科技评论(ID:aitechtalk) AI 科技评论按:人脸识别技术已经进入了大规模应用,个人数据的隐私问题也得到越来越多关注,针对隐私保护.躲避和攻击人脸识别系统的研究也陆 ...

  5. Colab不好用,有人花两年开发了一个新notebook,支持实时协作还更快

    机器之心报道 机器之心编辑部 工具不好用就自己开发一个,「不将就」的开发者就是这么任性. 市场上现有的数据科学 notebook 工具都有很多痛点,比如版本控制.可复现性.协作体验等,与其他工具配合使 ...

  6. 内存泄露 体现在哪个数字上_Microsoft刚刚泄漏了一个新的开始菜单。 你喜欢哪个?...

    内存泄露 体现在哪个数字上 @NTAuthority on TwitterTwitter上的@NTAuthority Microsoft messed up today, releasing an i ...

  7. sql 左联接 全联接_通过了解自我联接将您SQL技能提升到一个新的水平

    sql 左联接 全联接 The last couple of blogs that I have written have been great for beginners ( Data Concep ...

  8. 高通首次演示基于3GPP的5G新空口连接 有望成为全球标准

    在日前召开的"2017 Qualcomm 5G峰会"上,高通宣布成功完成其首个基于3GPP 5G新空口(5G NR)标准工作的5G连接,5G新空口有望成为全球5G标准. 该5G连接 ...

  9. 一个新时代的降临:智慧的医疗系统

    本文讲的是一个新时代的降临:智慧的医疗系统, 医疗和生命科学一直都是IBM关注的重点.目前,我们在全球有超过4,000名员工致力于医疗工作,其中包括了60多名医生和350名医疗专家.此外,我们还与1, ...

最新文章

  1. 计算器显示代码java_java编写的计算器源代码
  2. FZU2020 lucas定理求解组合数
  3. Spring Boot错误errMsg: request:ok
  4. C++中重载与重写函数区别及虚函数(转载)
  5. common lisp 学习第三天 函数、注释
  6. nginx php 源码安装,Nginx和php安装及配置一之编译安装nginx-1.8.0
  7. (89)Verilog HDL系统函数和任务:$fwrite
  8. Python+OpenGL进行立方体多纹理映射
  9. 微服务(接口)设计原则
  10. 监控易:智慧高校一体化综合运维解决方案
  11. vmware虚拟机使用多显示器
  12. python中for怎么无限循环_Python中无限循环有什么条件
  13. 如何解决Win10系统更新显示0x80070057代码的错误?
  14. 【Lintcode】1132. Valid Triangle Number
  15. 奥村マヨ - 見えない翼
  16. xmind新手入门教程,xmind怎么用?
  17. 多重积分matlab
  18. java通过API给企业微信用户发送微信消息
  19. 蓝桥杯 省赛真题寻找 2020
  20. Photoshop零基入门软件简单介绍

热门文章

  1. 【硬刚大数据之面试篇】2021年从零到大数据专家面试篇之Hbase篇
  2. 权限设计及算法(PHPE)
  3. 教你识别什么是一年工作经验by小新
  4. 小新pro13能转接网线吗_联想小新pro13air从那个接口连接网线
  5. 鼠标悬停(点击)出现文本提示框
  6. ECALL Swtichless调用及tRTS端Swtichless初始化
  7. 分享一个C#操作Word完整源码
  8. 期权分仓系统是什么?期权分仓软件的原理又是什么?
  9. 民宿管理软件免费的就是最好的吗?
  10. 土地利用二级分类30米分辨率