转载:http://www.cnblogs.com/xudongliang/p/6497465.html

嵌合体序列:由来自两条或者多条模板链的序列组成,示意图如下:

在PCR反应中,在延伸阶段,由于不完全延伸,就会导致嵌合体序列的出现,以上图为例,

在扩增序列X的过程中,在序列延伸阶段,只产生了部分X序列延伸阶段就结束了,在下一轮的PCR反应中,这部分序列作为其相似序列Y的引物接着延伸,扩增就会形成X和Y的嵌合体序列;

在放一张具体一点的示意图,不完全延伸产生的序列作为下一轮PCR反应的产物,进行延伸

在PCR过程中,大概有1%的几率会出现嵌合体序列,所以在16S 扩增子测序的分析中,需要去除嵌合体序列

参考文章:http://drive5.com/usearch/manual/chimera_formation.html

转载于:https://www.cnblogs.com/renping/p/7397487.html

24、嵌合体序列Chimeras相关推荐

  1. QIIME 2用户文档. 17鉴定和过滤嵌合体序列q2-vsearch(2019.7)

    前情提要 NBT:QIIME 2可重复.交互和扩展的微生物组数据分析平台 1简介和安装Introduction&Install 2插件工作流程概述Workflow 3老司机上路指南Experi ...

  2. QIIME 2用户文档. 16鉴定和过滤嵌合体序列q2-vsearch(2018.11)

    文章目录 前情提要 鉴定和过滤嵌合体序列`q2-vsearch` 数据下载 无参嵌合体鉴定 可视化统计结果 过滤特征表和序列 过滤嵌合体和可疑序列 过滤嵌合但保留可疑序列 Reference 译者简介 ...

  3. 2017.10.24 上升序列 思考记录

    终于有会做的题了... 一开始想用正常的lis ,然后从前往后扫, 由于最优查询区间在序列上是按顺序单调递增的,所以想记录每个点取哪个值跳到哪,这样是n*m logn的 然后发现既然是单调递增的那直接 ...

  4. oracle的序列为什么会出错,Oracle系列:(24)序列

    什么是序列[Sequence] (1)类似于MySQL中的auto_increment自动增长机制,但Oracle中无auto_increment机制 (2)是oracle提供的一个产生唯一数值型值的 ...

  5. 扩增子分析解读4去嵌合体,非细菌序列,生成代表性序列和OTU表

    写在前面 之前发布的<扩增子图表解读>系列,相信关注过我的朋友大部分都看过了(链接直达7月文章目录).这些内容的最初是写本实验室的学生们学习的材料,加速大家对同行文章的解读能力. < ...

  6. 永恒python奇美拉_利用USearch去除嵌合体(chimeras)

    嵌合体序列指在pcr过程中,两条不同的序列产生杂交扩增的序列,属于人工污染,在ITS和16S分析中,应该首先去除,USearch提供去除嵌合体的功能 usearch -uchime_ref reads ...

  7. QIIME 2教程. 17鉴定和过滤嵌合体q2-vsearch(2021.2)

    鉴定和过滤嵌合体序列q2-vsearch Identifying and filtering chimeric feature sequences with q2-vsearch https://do ...

  8. QIIME 2教程. 17鉴定和过滤嵌合体q2-vsearch(2020.11)

    文章目录 鉴定和过滤嵌合体序列`q2-vsearch` 数据下载 无参嵌合体鉴定 可视化统计结果 过滤特征表和序列 过滤嵌合体和可疑序列 过滤嵌合但保留可疑序列 译者简介 Reference 猜你喜欢 ...

  9. QIIME 2用户文档. 17序列双端合并read-joining(2018.11)

    文章目录 前情提要 序列双端合并的另一种方法`read-joining` 数据下载 序列合并 查看合并序列的数据质量和摘要 序列质控 Deblur 查看Deblur特征表 导入双端合并的序列 导入序列 ...

最新文章

  1. mysql 2013错误解决
  2. okhttp连接池_OkHttp配置HTTPS访问+服务器部署
  3. Spring Rmi配置
  4. 学生信息管理系统c语言课设,学生信息管理系统C语言课设.doc
  5. CCF201712-2 游戏(100分)【模拟】
  6. 特殊权限之sticky
  7. 挑战性题目DSCT102:木板切割问题
  8. activitymq 集群构建
  9. 带你快速入门计算机网络模型与5G协议!!
  10. python高维数据可视化_【机器学习】(十六)主成分分析PCA:高维数据可视化、特征提取...
  11. PHP+Javascript实现拖动滑块完成拼图验证码
  12. Pytorch介绍以及基本使用
  13. vue+element中多选框选一个然而就全部选中了
  14. 性能测试培训总结-spotlight on mysql
  15. d3.js一个面积图的案例(包含brush与zoom)
  16. 音准听力测试软件app,听音练耳app神器考试用
  17. 如何确定自己不是高智商?蒙提霍尔三扇门问题
  18. matlab如何导入大量的图片_本期介绍:如何在论文中插入高清的图片
  19. 魔兽世界怀旧服务器无限刷怪点,魔兽世界怀旧服:50级物理刷怪升级攻略!无干扰每小时4万经验!...
  20. linux--通配符的使用

热门文章

  1. libIlmImf-2_2.so.22 :cannot open shared object file :No such file or direct
  2. Python+OpenCV 图像处理系列(5)—— 图像 ROI 操作及通道的拆分合并
  3. javascript的知识总结
  4. SpringBoot2.x 不反回空值属性
  5. 【Sql Server】Database-存储过程
  6. 格式化_icecream_python
  7. Python第三方库jieba(中文分词)入门与进阶(官方文档)
  8. 自动机器学习(AutoML)
  9. Clang:LLVM的C语言家族前端
  10. 2021年大数据Spark(二十五):SparkSQL的RDD、DF、DS相关操作