【HPCC】在ubuntu下测试本机的HPCC分数

刚开始无从下手，不知该做什么，经过一番查询尝试以后，成功! 记录下整个流程。

测试了两种环境：

（1）win10的子系统ubuntu16.04，64bit

（2）win7系统 + VMware虚拟机下的Ubuntu16.04 LTS，64bit

注：文中涉及到的图片均为自己运行截图，转载请注明。执行成功的状态如下图所示：

1、下载HPCC基准测试程序并解压

地址：http://icl.cs.utk.edu/hpcc/

解压之后进入到其中的hpl下的setup文件如下左图所示，从中随便复制一个文件到上层目录，也就是hpl文件夹中。我选择的是Make.LinuxIntelIA64Itan2_eccMKL文件。粘贴到hpl中后修改文件名为Make.MKL，改成其他的也可以，比如Make.Linux都可以。(如下右图所示，因为我试了两种，所以两个文件都有，只需一个即可。)

2、编译配置

编译HPCC文件需要两个插件：Intel MPI和Intel MKL。（注：也可以使用mpich代替Intel MPI ，用BLAS代替MKL，但是由于未知原因在我的机器上一直出错，所以没采用，大家可以尝试一下。）

Intel MPI：https://software.intel.com/en-us/mpi-library

Intel MKL：https://software.intel.com/en-us/mkl

下载之后解压，在命令行运行安装程序进行图形化安装。以MKL安装为例，解压之后的图片如下图所示：

执行“./install_GUI.sh” 文件，如果习惯命令界面安装的小伙伴们可以执行" ./install.sh"

执行后会进入安装界面，一步步按操作来就可以了。默认安装在" /opt/intel" 下，我采用的是默认路径。MPI安装类似MKL。

有一点需要主要，Intel MPI安装之后会自动弹出一个网页，当时忘记截图了，里边注明了在使用MPI之前还需要的配置工作。简单来说就是按路径找到mpivars.sh文件，然后source一下。

大致路径如下图所示，source语句是 " source mpivars.sh"。如果不是在当前文件夹下需填写完整路径

" source /opt/intel/compilers_and_libraries_2018.5.274/linux/mpi/intel64/bin/mpivars.sh"

注：：首先我选择了默认安装位置"/opt/intel/"，所以没有修改环境变量，而且没有报错！！这个真的要看电脑，一个电脑一个样，如果之后编译hpcc文件时报 gcc:error的错误就是没有配置好环境变量。如果修改了安装路径就一定要配置环境变量。配置过程见3.配置环境变量

3.配置环境变量

完成第2步的操作后后配置环境变量：[root@localhost ~]# vi .bashrc

在.bashrc文件的末尾添加： export PATH=/usr/local/mpi/bin:$PATH

然后再保存退出后，再更新配置文件使其生效：[root@localhost ~]# source .bashrc

此处参考博客是：https://www.cnblogs.com/leijin0211/p/6851675.html

至此MKL和MPI的安装结束。

4.配置Make.MKL文件

此处参考博客是：

https://blog.csdn.net/jfsufeng/article/details/88734985

https://blog.csdn.net/u012927281/article/details/51443676

根据本机的情况，改写如下：

MP部分：

LA部分：

HPL_LIBS部分：

CC和LINKER部分：

修改路径的含义：

MPdir ：本机安装mpi的位置
MPinc ：mpi头文件所在的位置
MPlib ：mpi静态库所在的位置

LAdir        ：MKL所在的位置
LAinc       ：MKL头文件所在的位置
LAlib        ：MKL静态库所在的位置

CC ：选用的编译语句(mpiicc是使用Intel mpi ，mpicc是使用gcc)

HPL_LIBS：添加静态链接库(因计算机配置不同，不添加-ldl有些会报错，有些不会)

其余位置具体修改为什么，请参考上边的配置图片。

5.编译并执行

终于来到最后一步！

首先编译hpcc文件，执行目录是在hpcc程序的顶级目录中，如下图所示：

编译命令："make arch=XXX"，XXX是make文件的后缀名，比如我的是"make.MKL"，则编译命令如下图所示：

编译成功则会在此目录下生成一个hpcc的二进制文件，如果你生成成功，那恭喜你！离成功只差一步啦！

生成成功后，就可以执行了，执行命令"mpirun -np 4 ./hpcc"，如果报"cannot oprn file hpccinf.txt"的错误，则重命名当前文件夹下的_hpccinf.txt文件，去掉前面的下划线 "_"即可。

然后再重新执行，结果还是报错" Need at least 4 processes for these tests "：

解决方案：

如果hpccinf.txt文件中的两个变量Ps和Qs的积(Ps*Qs)大于设置的线程数时，可以修改两个变量的值使其乘积满足条件即可，或者减小线程数使其大于(Ps*Qs)。报错位置在＂hpcc-1.5.0/hpl/testing/ptest/HPL_pdinfo.c＂的第440行：

如果已经满足上述条件还不行的话，就关掉重启，然后再重新执行就可以了！(我的就是这样解决的。)

最后成功执行，执行图片就是帖子的第一张图。运行结果就是在当前目录下会自动生成一个hpccouf.txt文件，这个就是所需要的HPCC各种分数所在文件啦！

6.遇到的问题与解决方案

前边的部分列出了一部分问题，还有一些其他问题汇总如下。首先要准确定位错误原因，如下图所示这是看不出哪里出错的，一定要往上翻，找到有error的位置，也就是出错原因。

(1)出现未定义的引用，这个问题一般就是没有配置好环境变量。配置过程见前边的 "2和3"。

(2)出现" make:*** empty variable name. Stop "错误，是编译命令错误，不能加空格。去掉arch 、Linux与 = 之间的空格。

(3)出现以下错误，解决方案：源码安装mpich。

参考博客：https://www.cnblogs.com/leijin0211/p/6851675.html

(4)出现" DSO missing from command line "错误，解决方案：修改Make.MKL文件中的HPL_LIBS，在" -lm "前添加" -lpthread " 和 " -ldl "，配置文件见前边的 "4.配置Make.MKL文件"

(5)如果同时安装了OpenMpi和Intel MPI，是有可能出现冲突的

(6)报错" Need at least 4 processes for these tests "，这个问题没有彻底解决，取巧使用了其他方法处理了，过程如下。

可能是mpirun本身的问题，使用which查看，此时使用的mpirun是Intel MPI的mpirun，一直会报错：

转移到root下使用which 查看，发现使用的是之前安装的mpich的mpirun，这次顺利执行，但是执行时间明显比使用Intel MPI的时间要长：

使用Intel MPI的mpirun在出错后也成功过，过程就是ubuntu崩溃了，然后不得不重启，结果就好了。显然这个方法太偶然了，之后再执行依旧会有问题。

最后祝大家都顺利成功！！！问题6如果哪位朋友解决了，麻烦您请一定告诉我，在此多谢各位了！！！