MICCAI 2020 Challenges


1

REFUGE2
2nd Retinal Fundus Glaucoma Challenge
第二届眼底青光眼竞赛

文档:
https://zenodo.org/record/3714947#.XuS2R2ozZQI
竞赛:
https://refuge.grand-challenge.org/

  • 临床青光眼的分类;
  • 视盘和杯的分割;
  • 中央凹的定位,重视临床应用和技术研究
    3月10日: 开始(训练400 +验证400 +测试400)
    7月1日: 团队注册
    7月20日:验证集和评估开启
    8月10日:半决赛dealine截止
    9月5日:报告提交截止
    9月10日:最终截止
    10月8日:现场

组织方会prepare综述论文,投稿到IEEE TMI和或MedIA
train 400
val 400
test 400


2

HECKTOR
3D Head and Neck Tumor Segmentation in PET/CT
(PET/CT三维头颈部肿瘤分割)

文档:
https://zenodo.org/record/3714957#.XuSjtmozZQJ
竞赛

https://www.aicrowd.com/challenges/hecktor
探索和比较各种方法来从两种模式中提取和合并信息,包括早期或晚期融合,基于全体积或基于补丁的方法,2-D,2.5-D或3-D方法

多模态
6月10日:训练集发布
8月1日:测试集发布
9月1日-9月10日:提交
9月15:结果 发布
10月4日:研讨会
参赛者需要写overview论文
two co-authorships
多模态
201
每个实例包含
CT, PET and GTVt in NIfTI format
nii.gz

bbox_location.csv
patient_info_training.csv file


3

ABCs
Anatomical Brain Barriers to Cancer Spread: Segmentation from CT and MR images
(解剖脑部肿瘤扩散屏障分割)

文档:
https://zenodo.org/record/3746561#.XuS3jmozZQI

竞赛:
https://abcs.mgh.harvard.edu/
任务1.分割大脑结构,以用于自动定义放射治疗的临床目标体积(CTV)
任务2。任务 的目标是分割要在放射治疗计划优化中使用的结构。

CT/MR
多模态
xx:训练集发布
6月15日:发布测试数据(排行榜)

9月20日:发布测试数据(最终评分)
10月1日:意向提交论文
10月4日:结果公告
11月29日:最终paper
协调出版一份关于这一挑战的出版物
60例病例,每例包括计划的CT扫描和两次MR扫描


4

ASOCA
Automated Segmentation of Coronary Arteries(冠状动脉的自动分割

文档:
https://zenodo.org/record/3819799#.XuS5FGozZQI
竞赛:
https://asoca.grand-challenge.org/
血管分割
6月18日:训练集 发布
8月15日:测试卷
9月15日:提交deadline
9月30日:公布

ps:竞赛官网,受covid19影响,还没有发布
组织方会邀请前10名提交方法的作者(2位)作为co-authors

LightSpeed66s64slices
CT

(少了)


5

EMIDEC
Automatic Evaluation of Mycardial Infarction from Delayed-Enhancement Cardiac MRI(延时增强心脏MRI心肌缺血的自动评估

文档:
https://zenodo.org/record/3714998#.XuS7iWozZQJ
竞赛:
说是预计2月初开始,在challenge上发布,但是没找到
1、正常病理二分类
2、检测

challenge 好像还没公布
4月中旬:训练集
7月中旬:发布测试集

4月中旬:开始注册
7月中旬:结束注册
7月底:结束比赛

组织方会summary结果,然后投稿到Q1杂志
150例


6

ACDC@LungHP
Automatic Lung Cancer Detection and Classification in Whole-slide Histopathology(组织病理学图像中自动肺肿瘤检测和分类)

文档:
https://zenodo.org/record/3715001#.XuS-AWozZQJ
竞赛:
https://acdc-lunghp.grand-challenge.org/Challenge/(2019)
分类和检测

xxxxxx
2020challenge 好像还没公布
4月30日 更新网站到2020年竞赛
5月30日 上传首批数据
6月30日 上传训练集
9月1日 上传验证集和测试集
织方会要求前10支队伍的作者(2位)作为高影响因子杂志的co-author
WSI图像


7

StructSeg 2020
Automatic Structure Segmentation for Radiotherapy Planning Challenge(解剖结构自动分割)

文档:
https://zenodo.org/record/3718885#.XuS_omozbOQ
竞赛:
在challenge上发布,文档说目前还没公布
只找到2019的
https://grand-challenge.org/challenges/?search=StructSeg
等更新
两种类型的癌症数据,
鼻咽癌和肺癌。

四个挑战性任务,

  • 头颈部CT扫描的高风险器官分割,
  • 胸部CT扫描的高风险器官分割,
  • 鼻咽癌的总目标体积分割,
  • 肺癌的总目标体积分割
    6月10日:训练集
    9月 10:截止
    9月 15:公布
    no
    每个队伍 可以自己papers
    120次CT
    其中包含1520多个器官或肿瘤注释

8

CADA
Cerebral Aneurysm Detection and Analysis(脑动脉瘤检测和分析)

文档:
https://zenodo.org/record/3715012#.XuTBdWozbOQ
竞赛:
https://cada.grand-challenge.org/

  • 第一项任务是发现动脉瘤;
  • 第二项任务是准确分割,以便对可疑动脉瘤的发展进行纵向评估。
  • 第三项任务是评估动脉瘤破裂的风险。

任务12

  1. 4月1日:注册
  2. 4月14日:训练数据发放
  3. 5月1日:测试结果上传
  4. 7月6日:测试数据发放

任务3

4月1日:注册
4月14日:训练数据发放
5月1日:测试结果上传
8月1日:测试数据发放

组织方组织发表LNCS论文集
任务12

据是rotational x-ray血管造影/C-Arm,23套测试,92套训练验证

任务3


9

CPM-RadPath
Computational Precision Medicine Challenge on Brain Tumor Classification(计算精准医学放射学-病理学竞赛:脑肿瘤分类

文档:
https://zenodo.org/record/3718894#.XuTEsmozbOQ
竞赛:
https://miccai.westus2.cloudapp.azure.com/competitions/1
放射学(MRI)和组织病理学两种数据

脑肿瘤分类

跨模态数据

  1. 4月15日:注册 4月22日:训练阶段 7月9日:验证
  2. 8月5日:测试
    8月11日:结束
    完成validation阶段的参赛者可以发表short papers(LNCS)
    组织方会写summary,参赛者可以co-authored
    数据是MR和数字病理,训练270cases,验证78cases,测试40cases,共388cases,可能还有额外100cases作为测试

10

DFUC 2020
Diabetic Foot Ulcers Grand Challenge(糖尿病足溃疡竞赛

文档:
https://zenodo.org/record/3731068#.XuTLQmozZQI
竞赛:
https://dfu-challenge.github.io/

糖尿病足溃疡检测

  1. 4月27日:训练数据发放
  2. 6月21日:验证数据发放
  3. 7月1日:测试数据发放
  4. 7月15日:提交deadline
    写总结论文
    训练2000张,验证200张,测试2000张包含DFU和non-DFU

11

EndoVis
Endoscopic Vision Challenge(内窥镜视觉竞赛

文档 :https://zenodo.org/record/3715646#.XuTMvmozZQJ
竞赛:

过期了


12

International Skin Imaging Collaboration Challenge: Using Dermoscopic Image Context to Diagnose Melanoma(皮肤镜黑素瘤诊断)

文档:
https://zenodo.org/record/3715750#.XuTMpWozZQJ
竞赛 :
https://challenge.isic-archive.com/

  • 任务1:皮肤镜图像分类without患者上下文信息
  • 任务2:皮肤镜图像分类with患者上下文信息
    未出
    arxiv
    数据是皮肤镜图像啦,训练15000,验证100用于提交,测试5000

13

ADAM
(ADAM) Intracranial Aneurysm Detection and Segmentation Challenge(颅内动脉瘤检测和分割竞赛

文档:
https://zenodo.org/record/3715848#.XuTOf2ozZQI
竞赛:
http://adam.isi.uu.nl/

  • 任务1:颅内动脉瘤检测
  • 任务2:颅内动脉瘤分割
    ToF-MR和结构MR图像
  • 4月3日:训练集
    8月17日:最终提交
    9月20日 :top10 展示
    10月8日:结束
    anisers’ 组织方会发表杂志论文
    任务1:
    数据是ToF-MR和结构MR图像,训练110,测试140,修改为训练113套(包含20套没有针对颅内动脉瘤,93套有未破裂颅内动脉瘤),测试142套(不发布))

任务2:
数据是ToF-MR和结构MR图像,训练110,测试140,修改同上任务1)


14

VerSe’20
Large Scale Vertebrae Segmentation Challenge(大规模椎骨分割竞赛)

文档:
https://zenodo.org/record/3759104#.XuTRKWozZQI
竞赛:
https://verse2020.grand-challenge.org/
任务1:椎骨标记
任务2:椎骨分割

  1. 5月15日:训练集
  2. 7月20日:测试集,评测开启
  3. 7月24日:关闭

基于VerSe’20,组织方会提交杂志论文,还给出了详细的日程:2020年12月提交到arXiv,2021年2月提交到期刊
训练100套,public测试100套,private测试100套


15

L2R
Learn2Reg(学习如何回归)
配准

赛结果会发表IEEE TMI或MedIA,建议参加者提交LNCS论


16

MOOD
Medical Out-of-Distribution Analysis Challenge(医疗分布外分析挑战)

文档:
https://zenodo.org/record/3784230#.XuTSeWozZQI

竞赛:

1、首先是样本级别(即患者级别)的分析,从而检测出分布不佳的样本
2、体素水平的分析,即给每个体素一个分数,突出异常状况并可能指导医生
5月1日:数据发布
9月 6日:注册截止
9月7日:docker截止
10月8日:公布结果
10月15日:公开排行榜
组会出版

  • 脑部:800次扫描(256 x 256 x 256)
  • 腹部:550次扫描(512 x 512 x 512)

17

BraTS 2020

MICCAI Brain Tumor Segmentation (BraTS) 2020 Benchmark: "Prediction of Survival and PseudoprogressionMICCAI脑瘤分割(BraTS) 2020基准:“生存和假进展的预测

文档:
https://zenodo.org/record/3718904#.XuTUR2ozbOQ

竞赛:
https://www.med.upenn.edu/cbica/brats2020/
任务1术前MRI扫描中神经胶质瘤的分割

任务2:对患者总体生存的预测

任务3:肿瘤复发与治疗相关效应之间的区别
5月18日:训练集
6月26日:验证集
7月25日:提交短篇论文
8月17-28:测试集,在线评估

9月4日:top,展示

发 workshop’s LNCS
train 420
val 150
test 230


18

M&Ms
Multi-Centre, Multi-Vendor & Multi-Disease Cardiac Image Segmentation Challenge(多中心、多厂商、多疾病心脏图像分割的挑战)

文档:
https://zenodo.org/record/3886268#.XuTV3mozZQI

竞赛:

分割问题
5月1日:训练集
7月1日:注册
7月8日:最终评估
7月15:paper提交
10月4日:workshop 、测试结果
挑战日记纸将准备并提挑战日记纸将准备并提s
training set (150+25 studies)

Testing set (200 studies)


19

MyoPS 2020
Multi-sequence CMR based Mycardial Pathology Segmentation Challenge基于多序列CMR的心肌病理分割挑战

文档:
https://zenodo.org/record/3715932#.XuTV3mozZQI

竞赛:

http://www.sdspeople.fudan.edu.cn/zhuangxiahai/0/MyoPS20/data1.html
多序列CMR数据
结合多序列CMR数据对心肌病理进行分割

病理学分割

-心肌分割

-心脏图像处理

  • 心脏图像的配准和建模

今年,我们特别关注心肌病理学分割,并将评估提交的分割结果
论文+评估测试集
考虑发论文

tmi或者mia
45位患者的三序列CMR


20

QUBIQ
Quantification of Uncertainties in Biomedical Image Quantification生物医学图像量化中不确定性的量化

文档:
https://zenodo.org/record/3718912#.XuTV32ozZQI

竞赛:
https://www.ub.edu/mnms/

challenge journal papers


21

RibFrac
Rib Fracture Detecion and Classification Challenge
肋骨骨折的检测和分类挑战

文档:
https://zenodo.org/record/3715934#.XuTV3WozZQI

竞赛:
https://ribfrac.grand-challenge.org/
检测

分类
6月7日:训练验证
6月1-8月31:注册
8月24:测试集发布
8月31-9月13:提交
合作发论文 会议
可以通过660台计算机断层扫描(CT)扫描自动检测和分类约3,000处肋骨骨折,其中包括420台训练CT(全部有骨折),80台经过验证的CT(20部没有骨折)和160项评估CT


22

SuperMUDI2020
Super-resolution of Multi Dimensional Diffusion MRI Data

多维扩散MRI数据的超分辨率

文档:
https://zenodo.org/record/3718990#.XuTV5WozZQI
pass


23

PANDA
The PANDA challenge: Prostate cANcer Detection Assessment using Gleason Grading of prostate biopsies熊猫挑战:前列腺癌检测评估使用格里森分级的前列腺活检

文档:
https://zenodo.org/record/3715938#.XuTc6WozZQJ

https://www.kaggle.com/c/prostate-cancer-grade-assessment/overview/timeline
前列腺活体组织切片的自动Gleason分级

分类任务

kaggle

7月15:entry截止
7月15:组队截止
7月 22:截止
组织方与top-10参赛团队合作撰写期刊论文,介绍竞赛、数据集和结果
训练约11000套,public测试约400套,private测试约400套


24

TN-SCUI2020

Thyroid Nodule Segmentation and Classification in Ultrasound Images
超声图像中甲状腺结节的分割与分类

文档:
https://zenodo.org/record/3715942#.XuTc_2ozZQJ

竞赛:
https://tn-scui2020.grand-challenge.org/Dates/

  • 任务1:甲状腺结节分割,良性和恶性结节都需要分割
  • 任务2:甲状腺结节分类,良性和恶性二分类
    4月1日报名
    5月1日:训练集
    7月7日:测试集
    7月30日:截止提交
    8月 15日:公布邀请
    10月 8日:研讨会
    优胜者做presentation和发表workshop论文。
    训练集有3644张,测试集有500张

25

AutoImplant
Towards the Automatization of Cranial Implant Design in Cranioplasty
朝向颅骨成形术中种植体设计的自动化

文档:
https://zenodo.org/record/3873195#.XuTV62ozZQI

pass

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