FPKM,RPKM,TPM和RSEM
详细见孟叔的文章。
转载于:https://www.cnblogs.com/junjun-saber/p/10040963.html
FPKM,RPKM,TPM和RSEM相关推荐
- FPKM\RPKM\TPM学习[转载]
转自:http://www.360doc.com/content/18/0112/02/50153987_721216719.shtml 1.问题提出 在RNA-Seq的分析中,对基因或转录本的rea ...
- RPKM、FPKM和TPM的区别
前言 在RNA-Seq的分析中,我们常用RPKM.FPKM和TPM作为转录组数据定量的表示方法.它们都是对表达量进行标准化的方法,为何不直接用read数表示,而选标准化呢,因为落在一个基因区域内的re ...
- 转录组表达量计RPKM、FPKM、TPM说明
在转录组测序(RNA-Seq)中,基因的表达量是我们关注的重点.基因表达量的衡量指标有:RPKM.FPKM.TPM. RPKM:Reads Per Kilobase Million:说实话,这个英文说 ...
- 衡量基因相对表达量的RPKM、FPKM、TPM详解
衡量基因相对表达量的RPKM和FPKM.及TPM 1.RPKM(Reads Per Kilobase per Million)和FPKM(Fragments Per Kilobase per Mill ...
- 对FPKM/RPKM以及TPM的理解
虽然一直在接触FPKM/RPKM以及TPM,但是仅仅是知道它们是转录本定量的值,并未究其根本.最近看了几篇文献,对其深层次的含义有了进一步的理解,因而在这里记录下来. 首先来看FPKM/RPKM的起源 ...
- RPKM、FPKM、TPM
RPKM.FPKM.TPM RPKM(Reads Per Kilobase per Million) 每千个碱基的转录每百万映射读取的reads数 FPKM(Fragments Per Kilobas ...
- RPKM vs. FPKM vs. TPM
1,全称 RPKM: Reads Per Kilobase Million FPKM: Fragments Per Kiolbase Million TPM: Transcripts Per Mill ...
- 转录本counts,FPKM,TPM相互转化
FPKM: Fragments Per Kilobase of exon model per Million mapped fragments(每千个碱基的转录每百万映射读取的fragments) F ...
- Count,TPM,FPKM,CPM之间的格式转换——FPKM转TPM格式
在做转录组分析,下载的数据有各种形式,比如count,FPKM,tpm.我今年2月份发表的一篇文章,小修审稿人提出FPKM过时了,建议我换成CPM. 我特地去pubmed查了查,发现CPM确实比FPK ...
- rsem比对_科学网—FPKM, RPKM, RPM以及TPM的关系之见解 - 江纯阶的博文
FPKM,RPKM,RPM以及TPM的关系之见解 RPKM: Reads Per Kilobase of exon model per Million mapped reads (每千个碱基的转录每百 ...
最新文章
- 在特定索引处插入字符串
- Python简单主机批量管理工具
- Mysql 按条件排序查询一条记录 top 1 对应Mysql的LIMIT 关键字
- 常用贴片三极管主要参数
- python使用的编辑器_我用过的最好的python编辑器PyScripter
- promise链式调用_这一次,彻底弄懂 Promise
- 路印zkRollup AMM将在月底启动流动性挖矿
- 多肉建议多久浇一次水?
- 【转载】StreamInsight系列-QueryTemplate\QueryBinder\Query
- BlueHost怎样创建MySQL数据库
- Unity3D的音效相关介绍
- 2015第35周六转相见恨晚的知识列表
- 收货地址列表html,收货地址.html
- acl 影响因子_计算机领域EI和SCI收录期刊及影响因子
- 超参数(Hyperparameter)
- 最小生成树算法超详细教程
- 易语言的按钮事件(破解小技巧)
- Corba 学习笔记 (一)
- Eigen: C++开源矩阵计算库
- java jdk17 Tomcat