详细见孟叔的文章。

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FPKM,RPKM,TPM和RSEM相关推荐

  1. FPKM\RPKM\TPM学习[转载]

    转自:http://www.360doc.com/content/18/0112/02/50153987_721216719.shtml 1.问题提出 在RNA-Seq的分析中,对基因或转录本的rea ...

  2. RPKM、FPKM和TPM的区别

    前言 在RNA-Seq的分析中,我们常用RPKM.FPKM和TPM作为转录组数据定量的表示方法.它们都是对表达量进行标准化的方法,为何不直接用read数表示,而选标准化呢,因为落在一个基因区域内的re ...

  3. 转录组表达量计RPKM、FPKM、TPM说明

    在转录组测序(RNA-Seq)中,基因的表达量是我们关注的重点.基因表达量的衡量指标有:RPKM.FPKM.TPM. RPKM:Reads Per Kilobase Million:说实话,这个英文说 ...

  4. 衡量基因相对表达量的RPKM、FPKM、TPM详解

    衡量基因相对表达量的RPKM和FPKM.及TPM 1.RPKM(Reads Per Kilobase per Million)和FPKM(Fragments Per Kilobase per Mill ...

  5. 对FPKM/RPKM以及TPM的理解

    虽然一直在接触FPKM/RPKM以及TPM,但是仅仅是知道它们是转录本定量的值,并未究其根本.最近看了几篇文献,对其深层次的含义有了进一步的理解,因而在这里记录下来. 首先来看FPKM/RPKM的起源 ...

  6. RPKM、FPKM、TPM

    RPKM.FPKM.TPM RPKM(Reads Per Kilobase per Million) 每千个碱基的转录每百万映射读取的reads数 FPKM(Fragments Per Kilobas ...

  7. RPKM vs. FPKM vs. TPM

    1,全称 RPKM: Reads Per Kilobase Million FPKM: Fragments Per Kiolbase Million TPM: Transcripts Per Mill ...

  8. 转录本counts,FPKM,TPM相互转化

    FPKM: Fragments Per Kilobase of exon model per Million mapped fragments(每千个碱基的转录每百万映射读取的fragments) F ...

  9. Count,TPM,FPKM,CPM之间的格式转换——FPKM转TPM格式

    在做转录组分析,下载的数据有各种形式,比如count,FPKM,tpm.我今年2月份发表的一篇文章,小修审稿人提出FPKM过时了,建议我换成CPM. 我特地去pubmed查了查,发现CPM确实比FPK ...

  10. rsem比对_科学网—FPKM, RPKM, RPM以及TPM的关系之见解 - 江纯阶的博文

    FPKM,RPKM,RPM以及TPM的关系之见解 RPKM: Reads Per Kilobase of exon model per Million mapped reads (每千个碱基的转录每百 ...

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