pm3包1.8版本发布----一个用于3组倾向性评分的R包

目前，本人写的第二个R包pm3包的1.8版本已经正式在CRAN上线，用于3组倾向评分匹配，只能3组不能多也不能少。
可以使用以下代码安装

install.packages("pm3")

什么是倾向性评分匹配？倾向评分匹配（Propensity Score Matching，简称PSM）是一种统计学方法，用于处理观察研究（Observational Study）的数据，在SCI文章中应用非常广泛。在观察研究中，由于种种原因，数据偏差（bias）和混杂变量（confounding variable）较多，倾向评分匹配的方法正是为了减少这些偏差和混杂变量的影响，以便对实验组和对照组进行更合理的比较。
为什么需要做倾向评分匹配？
我们知道RCT的证据力度高，是因为对患者进行了严格的筛选。我们的回顾性研究都是过去的数据，很难像RCT一样进行严格的筛选出两组患者基线相近的基础资料，但我们可以通过倾向评分匹配把回归性的数据进行筛选，把基线资料相近的患者进行匹配，得到近似RCT的效果。
应用场景
 1.基线资料不平
 2.开展病例对照研究病阳性例数较少，如罕见病研究
 3.将众多混杂因素变为一个变量：倾向值
以下为一个实例，没进行匹配前两组患者基线资料相差很大，进行倾向评分匹配后，基线资料近似一致了

1.8版本修正了前面版本的一些错误，主要修正了两个问题：1是1.4版本的X变量如果是数字的话必须是1,2,3 ，1.8版本对变量进行了重编码，只要X是3分类就行，字符变量或者数字都可以,不在对数字有要求。2.是修正了对缺失数据的处理形式，进一步提高了上手性。下面我一一道来。
上一个版本中，X变量如果是数字来表示的话必须是1,2,3，使用0,1,2或者其他的数列都会报错。下面我们来试一下1.8版本，我先导入我们的早产数据，

bc<-read.csv("E:/r/test/zaochan.csv",sep=',',header=TRUE)
bc$race<-ifelse(bc$race=="black",0,ifelse(bc$race=="white",1,2))

我们可以看到race这个变量现在是0,1,2，以往1.4版本是做不了的，必须改成1,2,3，现在新版本就没有这个问题了

g<-pm3(data=bc,x="race",y="low",covs=c("age","lwt","ptl"))

一句代码结果就出来了，较原来方便了许多。再来就是改变了缺失值的处理方式，因为粉丝收集的数据大都有缺失值，有些变量的缺失值还是挺多的， 1.4版本对缺失值的处理可以说是简单粗暴，直接删除，但是数据中如果不需要使用的变量缺失值很多，会导致了大量数据被删除，导致我们的分层变量数会减少，导致X变量的数变少，1.8版本引入了一个变量psid，先进行匹配，后期在进行数据匹配，这样使数据利用效率大大提高，下面一个例子说明，1.4版本：

library(pm3)
bc<-read.csv("E:/r/fensi/data8.csv",sep=',',header=TRUE)
g<-pm3(data=bc,x="group",y="solidfoodintroductionlessthan6m",covs=c("femaleage","gestationalweeks","childgender"),factor=c("childgender"))

主要是这些用不到的变量缺失太多了

1.8版本避开了这个问题，还是同样的数据，同样的代码

bc<-read.csv("E:/r/fensi/data8.csv",sep=',',header=TRUE)
g<-pm3(data=bc,x="group",y="solidfoodintroductionlessthan6m",covs=c("femaleage","gestationalweeks","childgender"),factor=c("childgender"))

再来说说factor这个参数，这个参数就是把数据中的变量变成因子，在上面的例子中，factor=c(“childgender”)，其实就是相当于

bc$childgender<-as.factor(bc$childgender)

如果你在前面（计算前）就已经把分类变量转成因子了，factor不填就行了。

OK，新版本改动其实在构架来说还是蛮大的，但是做起来应该更简单了，如果有什么问题或建议，欢迎你来告诉我。

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