如何快速查找指定基因的调控网络
最近在看生信宝典的书籍,无意中发现了这个:
EVEX在线查询数据库(http://evexdb.org/)是一款以基因为检索对象,以PubMed和PubMed Central中发表文章的摘要和全文为依据的文本挖掘(text mining)数据库。由于检索结果都是以被检索的基因为中心,因此条理非常清晰。
输入一个gene,可以看到与之相关的有四类基因
继续点开后可以看到支持这一调节关系的原文。
EVEX数据库还可以同时检索两个基因,这将显示这两个基因之间的调节关系。
点击Show interactions
之后可以看到两个基因之间的各种调节关系。可以直接查看,也可以导入Cytoscape
绘制调控网络图
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