关注公众号:Sci科研助力

筛和猜,你pick哪一个?
常言道,万变不离其宗,科研亦如此,无论其外在形式如何复杂多变,其内在的逻辑论证规律始终不变,而这便是基础科研中所谓的套路。
然而,科研中的套路既来源于文献又高于文献,零基础科研者们如若不经过一番摸爬滚打,只怕很难真正领悟其中奥义。
而在充分理解了科研论证的逻辑规律后,课题设计的研究框架很容易就能从诸多文献中提炼出来。接下来无非就是将研究内容框架转变为填空题,便于后续类似研究方向的课题开展。
只有如此,科研课题的快速设计才不再是一句空话,且能很快的转为论文输出。
01
然而,套路虽好,但其所带来的千篇一律,却会触犯科研创新的大忌。所以需要恒量与变量多重组合的巧妙搭配,打破科研创新瓶颈。这其中,分子变量就是文章演变出“新花样”的关键所在。
就分子创新而言,一般主变量的创新可分为两种:一类是大的创新,是主变量跟表型之间完全没有报道过;其次是微创新,就是指主变量在其他的研究中有提示,可以得到这个结果。
毫无疑问,前者才是文章刊登于高影响因子期刊的一块敲门砖。
在眼下的生物大数据时代,高通量技术的飞速发展使得相关的基因数据直线飙升,置身于其中,很容易就有一种乱花渐欲迷人眼的感觉,不知道该如何取舍。
02
那么在这浩如烟海的分子中,究竟哪一个才是独属于自己的“宝藏”分子呢?
别急,本喵大大的六字真诀“要么筛,要么猜”,可解大家的燃眉之急。

筛,就是用自己的样本做高通量筛选或者用现有的公共数据库进行数据挖掘,得到一系列的差异基因列表,然后通过对该列表进行整合分析,如交互作用网络分析、功能聚类分析和相关通路分析,就可在差异性分子中寻到以下线索:
1)谁身居要位,成为调控网络的节点;2)与哪些表型密不可分,相关性最高;3)跟哪些已知的通路调控关系牵扯不清,确定机制研究的大致方向。
猜,就是查阅文献,看看分子的亚细胞定位、分子结构域,看看新发表文献中的分子是否在本领域发表过,从而找到1个或几个分子,再进行后续的湿实验验证。
03
至于筛、猜之间如何选择,本喵同样有一个六字真言送给大家——“有钱筛,没钱猜”。
高通量数据筛选方法虽然多,但最常见的技术平台就三个:芯片、测序和质谱。其中,芯片和测序均可从DNA/RNA水平来筛选靶分子,而质谱则可从蛋白水平和代谢组学水平来筛选靶分子。
在筛选的靶分子中,通常以转录水平的分子为最优选。一般而言,这三种高科技含量的实验技术是不需要自己做的,可找相应的外包公司获取服务。
所以如果你研究经费充足(8-10万或更多),在进行临床样本的高通量筛选时,可用二代测序去检测非编码RNA(如lncRNA、circRNA)的差异分子。如果预算紧凑(三五万),表达谱分析编码基因差异也是个不错选择。
04
而如果你囊中羞涩,那么你也可以在已有的高通量数据中挖掘自己个性化分子研究分析。
在数据挖掘中,你应该高效率地从众多的差异表达分子中建立一个10-20个分子的精选列表,进而优中选优,选出需要进行实验验证的分子。筛选过程中,除了差异表达的倍数要显著以外,更多地需要考虑课题主变量的创新性问题。
不过,有些时候可能你既无相关高通量数据,也没钱做筛选,这时也不要手足无措,因为你仍可直接从文献里挑选分子。
一般建议大家首先选定3-5本自己研究领域里面的权威期刊(IF>=10,二阶水平),并找出这些杂志上最近3个月发表文章所研究的分子,再以Pubmed检索来检测分子的新颖度。
选中三五个分子后细读文章来了解分子的背景,随后再直接对这个候选分子进行表型验证。注意,这里的疾病和表型都不能跟原来的文章一样,否则文章创新性会大打折扣。
05
然而,无论是筛,还是猜,只是确定了候选分子的大概来源,而我们所需的靶分子有很大概率能从中得以确定。
至于挑选的候选分子有无效果,仍需要分子和细胞水平的实验验证后方能知道。
而若要想快狠准的找到独属于自己的靶分子,就必然要遵从谋求验证获得阳性结果的最佳策略——“通量克服概率”定律。
因为只有同批次多做几个候选分子,才可规避客观的科研风险,提高把偶然性转化为必然性的可能性,确保在一个实验周期内能获得有价值的研究成果。

还在为课题设计烦恼、秃头。教你一招,一次性解决相关推荐

  1. 怎么减少计算机内存占有,还在为电脑内存占用太高而烦恼吗?教你一招轻松解决...

    查毒了也不管用.结果是电脑的物理内存占用太高了,下面就教大家怎么减少物理内存,希望对您有所帮助! 1.启动"windows任务管理器",快捷键"alt+ctrl+dele ...

  2. 平面设计素材模板| 还在为封面设计烦恼么?

    画册的封面设计指画册内容.形式.开本.装订以及印刷后期的综合体现,好的画册封面设计 要从全方位进行考虑.设计者应根据画册的不同性质.用途和群体,把这三者结合起来.从而 对企业形象进行高度提炼,给受众带 ...

  3. 你们还在担心手机找不到?教你一招轻松搞定

    大家有时候会不会因为出门太急而找不到手机,其实我们只需要大喊一声,不管手机藏在哪个角落,我们都能听到手机的回应. 如果你用的是苹果手机,打开[设置]-[Siri与搜索],开启[用"嘿Siri ...

  4. 这个AI让马斯克头秃,还能帮他设计特斯拉

    杨净 发自 凹非寺 量子位 报道 | 公众号 QbitAI 当年轻的马斯克换上女装,是这个亚子. 好清秀的姑娘啊~ 而若加上胡子,就瞬间变成另一种"风味". 还可以看看马斯克过几年 ...

  5. 可以改动的option组件_告别秃头!设计让开发者省心的React组件(内含详细代码)...

    全文共7556字,预计学习时长20分钟 来源:Pexels 用"你秃了,你也强了"这句话来形容程序员再合适不过了. 但是,为了变强就必须付出"秃头"这种巨大代价 ...

  6. wps二维码根据一列自动生成_拯救秃头!WPS还能这么玩?

    hi,我是壹习君,今天的你们,感觉还好吗~说起WPS/Office系列软件,你最头疼的地方是哪里?是软件的某些功能不会用?是公式太复杂?是动画效果不会做?还是长文档排版太难?都!不!是!你最头疼的地方 ...

  7. 秃头青年25岁躺平,30岁开始醒悟,还来得及奋斗吗

    以前上学的时候老听人说程序员容易秃头,当时我没办法理解,不就是熬夜嘛,我天天通宵LOL不也一头秀发.毕业后我顺利进入了一家小公司写(chao)代码,然后我才知道,是我太天真了,这不是熬夜的事,一天天的 ...

  8. 全网唯一秃头数据集:20 万张人像,网罗各类秃头

    见过对植物图片数据集的,也见过对名人人脸数据集,但你见过专门针对「秃头党」进行分类和识别的吗? 一位印度学生 Ashish Jangra ,最近在 Kaggle 上发布了一个名为「Bald Class ...

  9. 家人介绍的91年程序员月薪15k,已秃头!女孩不乐意,妈妈却说往后你只会越找越差!...

    都说程序员又老实又能挣钱,是众多小姐姐们找对象时的首选.但一位91年的姑娘却为这事纠结得厉害,还和妈妈发生了分歧,跑到网上问大家"要不要听妈妈劝": 这姑娘陷入了许多人都曾烦恼的境 ...

最新文章

  1. poj 2337 Catenyms 【欧拉路径】
  2. apu和atom处理器两者的定位
  3. 超越RMI,高效Java remote调用
  4. javaweb----三层架构+
  5. 深入浅出理解 Variable used in lambda expression should be final or effectively final
  6. java使用:: 表达式_Java 12:开关表达式
  7. windows 7资源管理器崩溃解决方法
  8. 网络基础4(TCP三次握手,四次握手,TCP流量控制,TCP状态转换 , TCP异常断开,设置TCP属性,端口复用)
  9. Golang实践录:命令行cobra库实例
  10. 边缘计算与移动边缘计算联系
  11. esp8266开发入门教程(基于Arduino)——编程基础介绍
  12. SegNet(持续更新)
  13. Axure 基础教程
  14. idea 商业版 社区版_idea社区版和商业版的区别
  15. UE4之添加开场动画
  16. windows xp 打开文件夹慢的解决
  17. 统计学中假设检验有关P值的讨论
  18. JavaWeb(狂神老师上课笔记)
  19. A Game of Thrones(46)
  20. 爬虫实战 | 手把手用Python教你采集可视化知乎问题的回答(内附代码)

热门文章

  1. 千年庭院 -余秋雨
  2. Django中prefetch_related()函数优化实战指南
  3. 信息安全系统设计基础第八周总结
  4. RTX“远程登录”功能介绍
  5. 将服务器文件导入docker,将本地docker容器迁移到服务端
  6. python数值积分_Python-Scipy进行数值积分
  7. 职场知识:这 3 份程序员年终总结呈上,来年上级一定看重你!
  8. 100集华为HCIE安全培训视频教材整理 | 双机热备(六)
  9. android linearlayout最大高度,Android中最简单最常用的LinearLayout线性布局
  10. 多渔:聊聊投资,谈谈人生