GO分析,参数写得详细

clusterProfiler,含代码

clusterProfiler: 分析+可视化GO和KEGG富集
同上一个,但画图参数更详细

流程代码

参数详解

go <- enrichGO(genelist, OrgDb = org.Mm.eg.db, ont='ALL',pAdjustMethod 

R语言 GO|KEGG相关推荐

  1. 使用R语言解析kegg数据库get请求

    使用R语言解析kegg数据库get请求 1. kegg数据库get请求 虽然kegg数据库提供了相关的Restful API来请求数据,但使用get请求查询出的数据是没有格式的字符串,如下: 要得到具 ...

  2. R语言(ggplot2)画KEGG信号通路气泡图

    R语言(ggplot2)画KEGG信号通路气泡图 1. KEGG信号通路的数据表be like⬇ 需要将原始数据处理成至少包含Term\Count\pValue\EnrichmentScore四列的数 ...

  3. 写一个KEGG富集分析的R语言代码

    . 有很多方法可以在R语言中完成KEGG富集分析.这里是一个简单的代码示例: library(clusterProfiler) library(KEGG.db)# 读取基因列表 geneList &l ...

  4. 高级转录组调控分析和R语言数据可视化第十三期 (线上线下,7月底开课)

    福利公告:为了响应学员的学习需求,经过易生信培训团队的讨论筹备,现决定安排扩增子16S分析.宏基因组.转录组线上直播课.报名参加线上直播课的老师可在365天内选择参加同课程的一次线下课 .期待和大家的 ...

  5. 高级转录组分析和R语言数据可视化第十三期 (线上线下同时开课)

    " 福利公告:为了响应学员的学习需求,经过易生信培训团队的讨论筹备,现决定安排扩增子16S分析.宏基因组.Python课程线上直播课.报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线 ...

  6. 高级转录组分析和R语言数据可视化第12期 (线上线下同时开课)

    " 福利公告:为了响应学员的学习需求,经过易生信培训团队的讨论筹备,现决定安排扩增子16S分析.宏基因组.Python课程线上直播课.报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线 ...

  7. R语言完美重现STAMP结果图

    写在前面 之前写过一篇关于统计学软件STAMP的教程,使用STAMP对微生物群落数据进行统计学分析还是挺方便的,尤其是对R语言不是很熟悉的朋友来说,图形化的界面和相对简单的操作还是挺友好的. STAM ...

  8. 最后1周 | 高级转录组分析和R语言数据可视化第十一期 (报名线上课还可免费参加线下课)...

    " 福利公告:为了响应学员的学习需求,经过易生信培训团队的讨论筹备,现决定安排扩增子16S分析.宏基因组.Python课程线上直播课.报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线 ...

  9. 最后2周 | 高级转录组分析和R语言数据可视化第十一期 (报名线上课还可免费参加线下课)...

    " 福利公告:为了响应学员的学习需求,经过易生信培训团队的讨论筹备,现决定安排扩增子16S分析.宏基因组.Python课程线上直播课.报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线 ...

最新文章

  1. 卡尺测量的最小范围_工厂车间里常用的测量仪器使用方法介绍,你都会用吗?...
  2. 一行代码,得到最强时序基线!
  3. linux oracle 配置监听器
  4. Qt程序怎么在别人的电脑上运行
  5. 【static关键字的作用是什么?它用在什么场景?static关键字深度解析来袭】
  6. dependencies.dependency.version' for org.apache.commons:commons-math3:jar is missing
  7. 【CodeForces - 215A】Bicycle Chain (水题)
  8. 袁亚湘:愿为数学做更多
  9. linux pcie命令,setpci命令_Linux setpci 命令用法详解:查询和配置PCI设备的使用工具...
  10. linux 大数字 进制转换,Linux下用bc快速进行数字进制转换
  11. C#LeetCode刷题之#217-存在重复元素(Contains Duplicate)
  12. 《规范敏捷交付:企业级敏捷软件交付的方法与实践》——3.11 观点总结
  13. javascript操作cookie实例
  14. Kubernetes (K8s)安装部署过程(一)之证书安装
  15. airtest web 录制滑块_AirTest学习四,录制Web测试脚本
  16. Android 360全景视频播放。
  17. ubuntu鼠标指针替换
  18. 【R语言】RMarkdown使用
  19. 17:57:54.359 [main] WARN com.baomidou.mybatisplus.generator.IDatabaseQuery$D
  20. 多易教育KAFKA实战(4)-原理加强

热门文章

  1. ds 6.3 sight
  2. PHP排序--冒泡排序
  3. 【机器学习】贝叶斯分类(通过通俗的例子轻松理解朴素贝叶斯与半朴素贝叶斯)
  4. 谷歌浏览器安装VUE插件
  5. [Mac] 触控板鼠标点击(mouse-click)失灵
  6. Vue lrz localResizeIMG 压缩图片
  7. 华为交换机配置时区_把华为交换机设置成(NTP)时钟源服务器
  8. 医院管理中,什么才算得上智慧机房?
  9. 基于asp.net的园林绿化服务交易网站
  10. WCF学习(六):实例