window10解决SimpleITK无法调用ImageJ的问题
今天各种探索,终于解决了window系统SimpleITK无法调用ImageJ的问题,放在这里与大家分享,希望对大家有所帮助!
本人所使用的软件有:
- anaconda3
- python simpleitk的包
- imageJ
解决过程如下:
首先下载ImageJ并对ImageJ进行调整,来自以下博文:https://blog.csdn.net/PiaoLiangHXD/article/details/75009671
博文里的相关操作是:
ImageJ Installation
- Go to download ImageJ.
- Make sure to download the bundled with 64-bit Java 1.8.0_112 version
ImageJ Setup
- Go to download nifti.
- Download nifti_io.jar
- Go to \path-to-ImageJ\plugins\Input-Output
- Delete the existing nifti_io.jar file from the folder
- Copy the downloaded nifti_io.jar file into the folder
- Restart ImageJ and check if File -> Import -> NIfTI-Analyze is there
- If it is there, the plugin was successfully installed
默认python解释器的配置
添加到环境变量path D:\Anaconda3(根据anaconda3安装地址自行调整), 使系统默认使用anaconda3自带的python作为默认的python解释器
ImageJ位置调整
将调整好的ImageJ文件夹拖拽到Anaconda3\Scripts所在文件夹,如D:\Anaconda3\Scripts
环境变量path设置
- 在path中添加 D:\Anaconda3(根据anaconda3安装地址自行调整), 使系统默认使用anaconda3自带的python作为默认的python解释器
- 在path中添加Anaconda3\Scripts\ImageJ,如D:\Anaconda3\Scripts\ImageJ
- 我自己的目录如下:
重启jupyter notebook运行就可以了
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