networkx使用Graphviz画图要点

本文涉及的工具

Graphviz(官网)
Pygraphviz(安装Pygraphviz的正确姿势)
networkx(pip install networkx)

import networkx as nx
G1 = nx.MultiDiGraph()
node = ['A', 'B', 'C', 'D', 'E']
edge = [('A', 'B'), ('B', 'C'), ('C', 'D'),('C', 'E')]
for i in node:G1.add_node(i)
for i in edge:G1.add_edge(i[0], i[1])
G1.graph['edge'] = {'arrowsize': '0.5'} # 箭头大小
G1.graph['node'] = {'shape':'box'} # 节点形状
G1.graph['graph'] = {'splines': 'spline', 'rankdir':'LR'} # 线型与布局方向
A = to_agraph(G1)
A.layout('dot') # 布局方法
A.draw('./graph/test2.png')

1.修改节点边框颜色

G.add_node(node, color="red")

2. 修改节点背景颜色

G1.add_node(i, style='filled')
G1.graph['node'] = {'shape':'box', 'color':'red'}

3.中文乱码

在上述图中增加一个中文节点，发现中文无法正常显示
解决方法，在节点属性中添加指定中文字体，即可正常显示

G1.graph['node'] = {'shape':'box', 'color':'red', 'fontname':'FangSong'}

4. 其他节点与边属性

节点形状(shape)，节点的高度宽度或半径(width,height)，边的长度(len)，边的线形(spline)，箭头大小(arrowsize)，箭头方向(dir)等等，每个属性内部的内容详见Graphviz官网

5. 图形布局要点

Graphviz使用自动排版，提供了多种布局引擎，个人比较喜欢dot和neato排版，如果节点较多且节点标签文字比较长的话建议使用dot排版，否则neato排版更紧凑些,如下图所示。
当使用dot排版时，不建议使用curved曲线，因为该线形会穿过节点，影响美观性，建议使用spline样条线以及ortho正交线。下图展示了使用dot排版和curved曲线，可以看到部分曲线穿过了节点(为了隐去部分敏感数据信息，将中文字体使用乱码掩盖)
当画图时发现布局较难看的时候，可以尝试给边添加标签和权重，通过添加标签会对线条布局机制产生一定的影响，而权重则影响边的长度，权重越大的边，越短且越直。下面通过一个案例说明添加标签与权重对布局的影响。

第一幅图为使用dot布局机制和spline样条线，未添加标签和权重时的结果，可以看到左侧存在一条较粗的线对图片的美观程度产生较大影响。
添加标签,可以看到布局发生了调整，第一幅中左侧较粗的线现在调整到了图的中部
添加权重，那根较粗的线变成了垂直的线，图结构更加清晰，布局美观

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