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文章首发时间：2015年8月6日。

生物信息学习的正确姿势

NGS系列文章包括NGS基础、在线绘图、转录组分析 （Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析 （ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析 (重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程)、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘（典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step)）、批次效应处理等内容。

最近我拜读了各位送交的年度工作计划，仔细推敲后，仍感到有三个方面的问题十分严重：

1. 第一，对课题理解不够，有的根本谈不上理解，做了不止一年，尚未进入角色。

2. 第二，已经完成的工作量严重偏少，博士（有的是从本室硕士上来的）做了几年还未见到可以发表的东西。

3. 第三，在计划中倾向于以最低工作量结束研究。即游击战法。以消耗最少的人力来解决战斗。

这是从纸上看到的。

从实验室看到的现象是，有那么几位常不到实验室照面，似乎这里是一个可来可不来的地方。

而且愈未进入角色的，愈不钻研文献；

工作做得愈差的，愈少见做实验。

请各位想想，你不学，怎么能变内行？

你不干，怎么会有结果？

不钻研与自己课题密切相关的文献，不把实验室工作放在头等重要的位置上，不能算作一个名副其实的博士生。

写一点专题读书报告，其实是一个领域内进入角色的好方法。一篇不够，可以连续写几篇，直到把与研究课题有关的方面较好地弄懂为止。如果在写读书报告的同时，加进一点自己的见解就更好了。写得好的可以送出发表。这对加强业务能力，提高写作水平，深化对自己研究工作的感情和培养事业心都大有益处。

几年来我们大会小会说了很多，而至今交得很少。有人说是没有时间，我看是不愿投入时间。

对博士生而言，每天工作12小时是正常的，少于这个时间就不正常了；

每周工作六天半以上是正常的，少于六天半就不正常了。

我这里是基于美国PhD四年学制所得到的概念。在我们目前三年学制还要强制性学半年英语的情况下，上述时间的投入充其量也只是一个下限。

人生一世，应该追求有所建树。记得有一首诗：“朝为田舍郎，暮登天子堂。将相本无种，男儿当自强”。

此诗所描述的虽有些封建意识，倒也道出了人生的真谛。想稍加以补充的是在男女完全平等的时代里，女儿也应当自强。走到了做科学这条路上，博士生阶段有无成就与将来有无建树关系十分密切。

椐我观察，在我们这一代人中凡是后来有所成就者，大多在博士学习阶段就奠定了很好的基础。

我理解的基础含三个方面的内容：

一是广博的知识和不断求知的欲望；

二是作为今后发展基础的工作成就；

三是不断进取的奋斗精神和以工作作为第一需要的人生观。

试想：要建功立业，博士生阶段不搏，更待何时？有的研究生说，在我们这个实验室读研究生如何如何辛苦，在有些地方读研究生如何如何轻松，入错了门的委屈和追悔不及的心情溢于言表。我不知道是该“轻松”的羡慕“辛苦”的，还是象我们“辛苦”的研究生这样羡慕人家“轻松”的。

但就我看来，身在国家级的实验室里，从事着国际前沿的研究工作，要做的工作都有相应的保证条件，大可一展才华，以慰平生，应该受到全校乃至全国的羡慕，而不是相反。对“轻松”妄加羡慕的人，其实是没有弄清楚为什么读研究生这个最起码的问题，或者是读研究生的动机本来就存在问题。他们读研究生所看中的大约只是一张文凭，自己对自己就不抱成才的期望，这种思想倾向是应该下大功夫纠正的。

我们这里几乎所有的人都希望博士毕业后到国外去做博士后，我很赞成，并愿尽我之力给予支持。我很希望我们实验室出去的人将来在国际上都成为知名人士。

今后在我们室毕业的博士出国做博士后可能主要有两类途径，一类是经我提名推荐，另一类是博士生本人争取，而将以后者为主。而后者却意味着要参与国际竞争。

博士论文做得好，竞争性就强，我也乐意推荐，用人方也愿意接收。博士论文做得不好的，我不愿意推荐，而且推荐起来难度也大。

其实，各人的路在各人自己脚下，各人的命运在各人自己手里。成败兴衰，全在各人，请各自勉。

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