CT的原始图像.dcm文件的读取

在做CT图像的深度学习研究时，需要用到大量的CT数据，我从TCIA上下载的CT图像是.dcm文件的，每个.dcm文件代表一个slice，如图所示，下载的是Head-neck数据，

用matlab读取时，使用到dicomread()函数，如下

filepath = '000000.dcm'
info = dicominfo(fullfile(filepath));
image = dicomread(info);

这里只读取了一个slice，我们该如何批量读取.dcm文件呢？又如何把每层的图像数据进行排序？以下是参考代码：

主要有几点需要注意：

读取info中的层数信息，用于排序
把多余的空白数据删除

clear,clc%% reading files path
folder = './4/';         %%% 所有slice的文件夹ext = {'*.dcm'};
filepaths = [];for i = 1 : length(ext)filepaths = cat(1,filepaths,dir(fullfile(folder, ext{i})));   %%% 读取所有.dcm的文件
enda = length(filepaths);
data = zeros(512,512,a);     %%% 图片大小
Num = zeros(1,a);for i = 1:a info = dicominfo(fullfile(folder,filepaths(i).name));      %%% 读取CT图像的扫描信息No = info.SliceLocation;                                   %%% 读取该层的序号Num(i) = floor(No);
endvalue = min(Num(:));%% extrating number of slices
for i = 1:a info = dicominfo(fullfile(folder,filepaths(i).name));No = info.SliceLocation;Num0 = floor(No)+ abs(value)+1;                            %%% 对slicelocation进行从小到大的排序image = dicomread(info);data(:,:,Num0) = image;     % saving data, including blanks
end%% delete the blank
n_dim = size(data,3);
t = 1;
for j = 1: n_dimimg = data(:,:,j);if mean(img)==0rem(t) = j;t  = t + 1;else   end
enddata(:,:,rem) = [];     %% 删掉空白的层
n = size(data,3);temp = data;%% show and save the result
for i = 1:ndata(:,:,n-i+1) = temp(:,:,i);
end
for i = 1:nimshow(data(:,:,i),[])
endsave pat4.mat data    %%% 保存数据

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