python如何读取.mtx文件
mtx文件是按照稀疏矩阵格式存储的矩阵数据,可以按照以下步骤读取:
1、安装scanpy包
1 |
|
2、文件读取
1 2 3 |
|
第一行read之后返回的是annData,第二行通过.X操作得到的是矩阵数据
3、转换为稠密矩阵
1 |
|
直接得到的矩阵是稀疏形式的,通过todense函数可转换为稠密矩阵
补充:python读取各种文件方式
Json:
1 2 3 4 5 6 |
|
Excel:
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 |
|
写EXCEL:
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 |
|
CSV:
1 2 3 4 5 6 |
|
txt:
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 |
|
以上为个人经验,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持主机吧。如有错误或未考虑完全的地方,望不吝赐教。
python如何读取.mtx文件相关推荐
- json字段顺序读取 python_如何利用Python批量读取视频文件的时间长度?
本期的主题是利用Python来实现对视频文件时间长度的读取. 在学习编程语言时,相比较于通过书本来学习知识,我更喜欢通过观看学习视频的方式来进行学习,通过主讲老师的讲解,我能很直观且快速的了解一些知识 ...
- python怎么读取txt文件内容然后保存到excel-Python实现读取txt文件并转换为excel的方法示例...
本文实例讲述了Python实现读取txt文件并转换为excel的方法.分享给大家供大家参考,具体如下: 这里的txt文件内容格式为: 892天平天国定都在?A开封B南京C北京(B) Python代码如 ...
- python导入txt文件并绘图-Python实现读取txt文件中的数据并绘制出图形操作示例
本文实例讲述了Python实现读取txt文件中的数据并绘制出图形操作.分享给大家供大家参考,具体如下: 下面的是某一文本文件中的数据. 6.1101,17.592 5.5277,9.1302 8.51 ...
- python读取整个txt文件-python怎么读取txt文件内容
读取文件: 步骤:打开 -- 读取 -- 关闭>>> f = open('/tmp/test.txt') >>> f.read() 'hello python! h ...
- python导入txt文件并绘图-Python实现读取txt文件并画三维图简单代码示例
记忆力差的孩子得勤做笔记! 刚接触python,最近又需要画一个三维图,然后就找了一大堆资料,看的人头昏脑胀的,今天终于解决了!好了,废话不多说,直接上代码! #由三个一维坐标画三维散点 #codin ...
- python读取txt文件代码-Python实现读取txt文件并画三维图简单代码示例
记忆力差的孩子得勤做笔记! 刚接触python,最近又需要画一个三维图,然后就找了一大堆资料,看的人头昏脑胀的,今天终于解决了!好了,废话不多说,直接上代码! #由三个一维坐标画三维散点 #codin ...
- Python数据分析·读取CSV文件转为字典
Python数据分析·读取CSV文件转为字典 1.pandas 读取CSV 2.CSV转为字典 3.CSV转为数组 Python pandas包可以直接读取CSV文件,为了接下来的数据分析,考虑到转为 ...
- 怎么退出python命令行cd找到txt文档_《python怎么读取txt文件》
python怎么创建一个txt文件 python怎么创建txt文件的方法. 如下参考: 1.首用内置的空闲编辑器编辑(单击并选择copy),如下图所示. 2.您可以下载记事本和其他编辑软件,以支持多种 ...
- Python+Pandas读取Excel文件分析关系最好的两个演员
董老师又双叒叕送书啦,6本<Python程序设计基础与应用(第2版)> 推荐图书: <Python程序设计(第3版)>,(ISBN:978-7-302-55083-9),董付国 ...
最新文章
- 计算机代码坑人小程序bat,批处理写的关机小程序--bat
- mysql服务重启后不见了_一次诡异的Mysql服务不断重启故障排查
- 京东双十一助推下沉市场消费升级,“消费平级”时代提前到来
- 国内开源软件镜像网站大全
- 高级 | Java中获取类名的3种方法
- 传惠普CEO李艾科将部署全新战略计划
- 如何使用指向类的成员函数的指针(详解!)
- 【Elasticsearch】es 报错 index has not yet rolled over with that alias
- java 中张孝祥老师_谁有传智博客张孝祥老师的Java视频——必须是完整的
- 大型任务处理:为虚拟现实游戏施展混合现实魔法
- 活动目录系列之二:单域环境的实现(单站点)
- Interesting Housing Problem HDU - 2426 (KM)
- css实现返回顶部,实现返回顶部效果
- 动视暴雪利润下降22%,投身移动端能否重回王座?
- 多玩网总裁李学凌:在腾讯阴影下
- 5A成绩通过PMP,备考经验总结——姜飞
- 【​观察】从移动计算当道 看高通“高举高打”背后的势能
- 你还不会用python进行数据分析吗
- 带你玩转序列模型之循环神经网络(一)
- Angular: ‘ng’ is not recognized as an internal or external command, operable program or batch file
热门文章
- php制作万年历的步骤_教大家制作简单的php日历
- Serv-U MDTM命令远程溢出分析
- P3466 [POI2008]KLO-Building blocks(Splay)
- [实用]推荐一些非常棒的前端网站
- Vue-Router 路由重复点击时报错 Uncaught (in promise) NavigationDuplicated:Avoided redundant navigation to curr
- 合肥师范学院计算机网络实验报告,合肥师范学院学生实验报告批阅办法
- 举例得到的遗传算法工具箱GA是求最小值的算法
- 【译】Flutter 2.0 正式版发布,全平台 Stable
- 40岁程序员写出租车一键下单电话叫车软件后被发帖骂骗子写得太烂
- JVM(五):类文件结构