肠道微生物是近两年的研究热点,但是去年登上Science封面的是一篇研究肿瘤中的微生物的文章,另人眼前一亮,有些肿瘤即使没有与外界环境相通,也是有微生物的存在的.外行看热闹,内行要看看他是具体怎么进行研究的. 首先是研究手段,并不是宏基因组,是16S,估计是由于肿瘤中的微生物含量过少,多数不能满足宏基因组的建库所需DNA的量.然后,作者是用了一种不同于常规16S的研究手段进行的,扩增并测序了5段V区(68%的长度),然后合并分析的,作者称之为SMURF的方法流程,认为这个方法是接近于三代16S全